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金虫 (小有名气)

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专业: 植物遗传学

[求助] 内参基因筛选问题已有1人参与

最近在做内参基因的筛选，对于normfinder的使用有点疑问。
最近在做内参基因的筛选，对于normfinder的使用有点疑问，以下2种数据输入哪种是正确的：
1、直接输入Ct值，选上log transform data进行分析
2、参考genorm的用法，即在所有PCR结果中找到Ct值最低的，所有其他数据以2^-δCT计算相对表达量，然后再将相对表达量的数据输入后用normfinder分析，此时不选log transform data
我用这2种方法都试过，但结果不一样。请问哪种方法是对的，或者二者都不对，正确的应该怎么使用，望高手解惑，不胜感激！！！

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1楼 2016-10-11 09:33:34

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Ivy尘

新虫 (正式写手)

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楼主，能不能发一份normfinder？我之前下载的打不开，不造为什么。。。

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3楼2016-12-05 15:59:22

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liushunyi1

新虫 (初入文坛)

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【答案】应助回帖

★
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2017-01-23 21:39:34

应该都可以吧，但我没用过，说明中是这样写的：The data are supposed to be on a linear scale. If your data are already log transformed (natural base (e) logarithm) this is acceptable too, if you uncheck the field “log transformed data”

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5楼2017-01-18 10:30:53

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