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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 内参基因筛选问题
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15836073150

金虫 (小有名气)

[求助] 内参基因筛选问题 已有1人参与

最近在做内参基因的筛选，对于normfinder的使用有点疑问。
最近在做内参基因的筛选，对于normfinder的使用有点疑问，以下2种数据输入哪种是正确的：
1、直接输入Ct值，选上log transform data进行分析
2、参考genorm的用法，即在所有PCR结果中找到Ct值最低的，所有其他数据以2^-δCT计算相对表达量，然后再将相对表达量的数据输入后用normfinder分析，此时不选log transform data
我用这2种方法都试过，但结果不一样。请问哪种方法是对的，或者二者都不对，正确的应该怎么使用，望高手解惑，不胜感激！！！
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1楼 2016-10-11 09:33:34
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pooh0216

铜虫 (著名写手)
★
xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-10-11 13:37:06
内容已删除
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2楼2016-10-11 10:21:01
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Ivy尘

新虫 (正式写手)
楼主，能不能发一份normfinder？我之前下载的打不开，不造为什么。。。
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3楼2016-12-05 15:59:22
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习惯肥嘟嘟

新虫 (初入文坛)
内容已删除
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4楼2017-01-10 17:09:32
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liushunyi1

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2017-01-23 21:39:34
应该都可以吧，但我没用过，说明中是这样写的：The data are supposed to be on a linear scale. If your data are already log transformed (natural base (e) logarithm) this is acceptable too, if you uncheck the field “log transformed data”
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5楼2017-01-18 10:30:53
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29在路上

银虫 (小有名气)
楼主 我也要做内参筛选，可以发我这两个软件么
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熬得住，出众；熬不住，出局
6楼2017-01-23 16:30:42
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王慕阮

新虫 (初入文坛)
楼主，你解决了吗？我也是发生了这样的情况，不知道改选择哪一种

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7楼2017-03-23 01:51:53
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OOHEROO

新虫 (初入文坛)
你可以看一下，胡金川的《如何利用geNorm软件筛选基因表达测定的内参基因》，希望对你有帮助，还想顺便问一下，你知道配对变异分析是怎么做的么？

发自小木虫Android客户端
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8楼2017-08-03 15:42:16
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