| 查看: 4917 | 回复: 11 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[求助]
求助16S rDNA测序结果分析 已有3人参与
|
|||
| 本人分子生物学小白一个。刚分离出一种细菌，并送生工进行了16S rDNA序列分析。返回的测序结果人家给做了正反向拼接。然后我直接在NCBI上黏贴了结果进行了比对。我想要确定这种细菌到底是什么，应该怎么做。用什么软件。求详细的解说过程。谢谢各位大神。 |
回复此楼» 猜你喜欢
筑牢营养安全线：以精准检测，护健康基石
已经有0人回复
-
推荐一些20种氨基酸检测的实际应用案例
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有154人回复
-
不合理蛙科研实验中的趣事：实验器材的 “乌龙”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验中的趣事：和实验材料的 “斗智斗勇”
已经有0人回复
-
蛋白质检测：精准分析，解锁生物分子的密码
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之小鼠实验：严谨设计，解析生命机制的重要载体
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之重金属检测：精准筛查，守护健康与环境的防线
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“蛙测重金属我背锅三千”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“鼠逃三次我发三篇SCI”
已经有0人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 细菌16S rDNA序列，总长在1024 bp，这样影响菌株同源性的鉴定吗
已经有0人回复
- 求助土壤总DNA提取和16S rDNA扩增
已经有15人回复
- 求助，16S rDNA测定了i两株菌的序列，大神们可以帮我分析下么？谢谢~！
已经有14人回复
- 用细菌16s rDNA构建进化树的问题
已经有3人回复
- 细菌16S rDNA的序列以及 V3区的序列
已经有3人回复
- 油藏微生物16S rDNA的扩增没有任何条带出现，请问是什么因素导致？
已经有0人回复
- [重金求助] 细菌鉴定的若干入门级问题请教(16S rDNA)
已经有10人回复
- 【求助/交流】扩16s rDNA时，以第一次的条带较淡的PCR产物为模板，为什么得不到清晰的
已经有12人回复
- 【求助/交流】可以向NCBI上传我的部分16s rDNA的特征片段吗？
已经有2人回复
- 【求助/交流】16s rDNA,在NCBI blast
已经有3人回复
- 【求助/交流】求细菌16S rDNA PCR的反应条件
已经有2人回复
- 【求助/交流】PCR上的目标基因的16S rRNA和16S rDNA问题
已经有4人回复
- 【求助/交流】16S rDNA和16S rRNA的比较问题
已经有1人回复
- 【求助/交流】求费氏丙酸杆菌费氏亚种的16s rDNA测序序列！
已经有0人回复
- 【求助/交流】怎么在ncbi上查询细菌的16s rDNA的全序列？
已经有3人回复
- 【求助/交流】如何作16S rDNA聚类/进化图？
已经有8人回复
- 【求助/交流】通过16or18s rDNA鉴定后，怎么确定是否是新的种属啊？
已经有7人回复
- 【求助/交流】16S rDNA测序 系统发育树构建 急！！！
已经有6人回复
- 【求助/交流】16s rDNA的V3区有多长
已经有1人回复
- 【求助/交流】请问细菌基因组16s rDNA拷贝数问题
已经有0人回复
- 【求助/交流】细菌16s rDNA 通用引物
已经有5人回复
- 【求助/交流】如何在NCBI上寻找不同细菌的16S RDNA序列？
已经有2人回复
- 【求助/交流】有没有同学做过16S rDNA PCR-RFLP，交流
已经有8人回复
过烟云烟
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 57 (初中生)
- 金币: 8014.7
- 红花: 21
- 帖子: 1616
- 在线: 353.5小时
- 虫号: 1406756
- 注册: 2011-09-18
- 专业: 神经生物学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
Mayday-zxm: 金币+5, ★有帮助 2016-09-28 19:03:44
感谢参与，应助指数 +1
Mayday-zxm: 金币+5, ★有帮助 2016-09-28 19:03:44
|
新分离的菌还要做形态学，生化鉴定，分子方面的鉴定用16s就可以了，和楼上说的一样的 发自小木虫Android客户端 |
3楼2016-09-28 17:22:20
781055707
木虫 (著名写手)
- 应助: 291 (大学生)
- 金币: 3118.2
- 散金: 46
- 红花: 19
- 帖子: 2030
- 在线: 579.3小时
- 虫号: 3046113
- 注册: 2014-03-13
- 性别: GG
- 专业: 生物大分子结构与功能
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
kuaile5420: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-09-28 18:15:33
Mayday-zxm: 金币+5, ★有帮助 2016-09-28 19:04:04
感谢参与，应助指数 +1
kuaile5420: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-09-28 18:15:33
Mayday-zxm: 金币+5, ★有帮助 2016-09-28 19:04:04
| 不同细菌的16S rRNA是不同的，你放NCBI上BLAST,百分比最高的就是了。 |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
2楼2016-09-28 16:52:15
送红花一朵 |
请问我要确定物种这样就可以嘛？我查了有关说明说还要, 运用 Clustal_X 软件多重序列比对测得的序列,依据最大同源性原则,再运用 MEGA 软件包打开比对结果, 系统进化树的构建在序列对比的基础上使用MEGA 4.1软件的邻接法构建Neighbor-joining系统等等 发自小木虫Android客户端 |
4楼2016-09-28 19:03:21
过烟云烟
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 57 (初中生)
- 金币: 8014.7
- 红花: 21
- 帖子: 1616
- 在线: 353.5小时
- 虫号: 1406756
- 注册: 2011-09-18
- 专业: 神经生物学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
Mayday-zxm: 金币+10, ★★★很有帮助 2016-09-28 21:01:30
Mayday-zxm: 金币+10, ★★★很有帮助 2016-09-28 21:01:30
|
你要深入研究的话就要做亲进化分析算遗传距离，如果只是想大概知道菌的名字就不用 发自小木虫Android客户端 |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
5楼2016-09-28 19:10:26