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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 分子生理 » T-DNA Primer Design设计拟南芥突变体筛选引物的问题
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damaoouba

木虫 (正式写手)

[求助] T-DNA Primer Design设计拟南芥突变体筛选引物的问题 已有1人参与

刚做到这个，所以很多都不是很明白，求大神指教
http://signal.salk.edu/tdnaprimers.2.html#opennewwindow在这个网站设计突变体筛选的引物。
想问一下，输入salk号后出来的LP、RP引物，在实际合成过程中需要反向互补一下再合成吗？还有LBB1、LBB1.3这俩引物应该如何选择？
筛选过程中，突变体纯合是不是应该LP+RP无条带，LBB1+RP有条带哦？
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1楼 2016-09-06 09:13:39
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wx1308897716

木虫 (小有名气)

神虫

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
damaoouba: 金币+5 2016-09-06 10:12:48
xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-10-11 13:35:30
xn8008: 应助指数+1 2016-10-11 13:35:38
不需要，你查出来后直接合成就行了，你就直接选lbb1.3呗，一般都没问题
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2楼2016-09-06 09:48:01
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damaoouba

木虫 (正式写手)
xn8008: 欢迎发帖交流 2016-10-11 13:35:34
引用回帖:
2楼: Originally posted by wx1308897716 at 2016-09-06 09:48:01
不需要，你查出来后直接合成就行了，你就直接选lbb1.3呗，一般都没问题

应该LP+RP无条带，LBB1+RP有条带撒？
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3楼2016-09-06 10:12:46
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)
xn8008: 欢迎发帖交流 2016-10-11 13:35:46
引用回帖:
3楼: Originally posted by damaoouba at 2016-09-06 10:12:46
应该LP+RP无条带，LBB1+RP有条带撒？...

是这样的
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4楼2016-09-06 12:16:42
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wx1308897716

木虫 (小有名气)

神虫
★
xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-10-11 13:35:53
引用回帖:
3楼: Originally posted by damaoouba at 2016-09-06 10:12:46
应该LP+RP无条带，LBB1+RP有条带撒？...

对，LP+RP无条带，LBB1+RP有条带是纯合体
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5楼2016-09-06 16:06:01
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380939643mmm

铜虫 (初入文坛)
★
xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-10-11 13:36:01
引用回帖:
5楼: Originally posted by wx1308897716 at 2016-09-06 16:06:01
对，LP+RP无条带，LBB1+RP有条带是纯合体...

http://signal.salk.edu/tdnaprimers.2.html#opennewwindow在这个网站设计突变体引物的参数不需要修改吗？直接出来就可以合成吗？那么LB1.3引物的温度怎么计算啊？刚刚开始做这个，不是特别懂，希望指教，谢谢！
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6楼2016-10-10 14:14:29
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wx1308897716

木虫 (小有名气)

神虫
★
xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-10-11 13:36:07
引用回帖:
6楼: Originally posted by 380939643mmm at 2016-10-10 14:14:29
http://signal.salk.edu/tdnaprimers.2.html#opennewwindow在这个网站设计突变体引物的参数不需要修改吗？直接出来就可以合成吗？那么LB1.3引物的温度怎么计算啊？刚刚开始做这个，不是特别懂，希望指教，谢谢！...

直接出来合成就行了，不用算，根据你rp直接扩，只要你不设置那么离谱都能扩出来
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7楼2016-10-11 09:44:34
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380939643mmm

铜虫 (初入文坛)
xn8008: 欢迎发帖交流 2016-10-11 13:36:18
引用回帖:
7楼: Originally posted by wx1308897716 at 2016-10-11 09:44:34
直接出来合成就行了，不用算，根据你rp直接扩，只要你不设置那么离谱都能扩出来...

好的， 我试试，再问下您，买到的拟南芥突变体种子以SALK开头，SALK_******(CF)/(AU)/(BU)，SALK数字后边的括号里的(CF)/(AU)/(BU)分别代表什么意思？
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8楼2016-10-11 10:40:14
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wx1308897716

木虫 (小有名气)

神虫
引用回帖:
8楼: Originally posted by 380939643mmm at 2016-10-11 10:40:14
好的， 我试试，再问下您，买到的拟南芥突变体种子以SALK开头，SALK_******(CF)/(AU)/(BU)，SALK数字后边的括号里的(CF)/(AU)/(BU)分别代表什么意思？...

没太留意，我也不知道
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9楼2016-10-11 14:26:15
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