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damaoouba

木虫 (正式写手)

[求助] T-DNA Primer Design设计拟南芥突变体筛选引物的问题 已有1人参与

刚做到这个,所以很多都不是很明白,求大神指教
http://signal.salk.edu/tdnaprimers.2.html#opennewwindow在这个网站设计突变体筛选的引物。
想问一下,输入salk号后出来的LP、RP引物,在实际合成过程中需要反向互补一下再合成吗?还有LBB1、LBB1.3这俩引物应该如何选择?
筛选过程中,突变体纯合是不是应该LP+RP无条带,LBB1+RP有条带哦?
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wx1308897716

木虫 (小有名气)

神虫

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
damaoouba: 金币+5 2016-09-06 10:12:48
xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-10-11 13:35:30
xn8008: 应助指数+1 2016-10-11 13:35:38
不需要,你查出来后直接合成就行了,你就直接选lbb1.3呗,一般都没问题
2楼2016-09-06 09:48:01
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damaoouba

木虫 (正式写手)

xn8008: 欢迎发帖交流 2016-10-11 13:35:34
引用回帖:
2楼: Originally posted by wx1308897716 at 2016-09-06 09:48:01
不需要,你查出来后直接合成就行了,你就直接选lbb1.3呗,一般都没问题

应该LP+RP无条带,LBB1+RP有条带撒?
3楼2016-09-06 10:12:46
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

xn8008: 欢迎发帖交流 2016-10-11 13:35:46
引用回帖:
3楼: Originally posted by damaoouba at 2016-09-06 10:12:46
应该LP+RP无条带,LBB1+RP有条带撒?...

是这样的
4楼2016-09-06 12:16:42
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wx1308897716

木虫 (小有名气)

神虫


xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-10-11 13:35:53
引用回帖:
3楼: Originally posted by damaoouba at 2016-09-06 10:12:46
应该LP+RP无条带,LBB1+RP有条带撒?...

对,LP+RP无条带,LBB1+RP有条带是纯合体
5楼2016-09-06 16:06:01
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380939643mmm

铜虫 (初入文坛)


xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-10-11 13:36:01
引用回帖:
5楼: Originally posted by wx1308897716 at 2016-09-06 16:06:01
对,LP+RP无条带,LBB1+RP有条带是纯合体...

http://signal.salk.edu/tdnaprimers.2.html#opennewwindow在这个网站设计突变体引物的参数不需要修改吗?直接出来就可以合成吗?那么LB1.3引物的温度怎么计算啊?刚刚开始做这个,不是特别懂,希望指教,谢谢!
6楼2016-10-10 14:14:29
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wx1308897716

木虫 (小有名气)

神虫


xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-10-11 13:36:07
引用回帖:
6楼: Originally posted by 380939643mmm at 2016-10-10 14:14:29
http://signal.salk.edu/tdnaprimers.2.html#opennewwindow在这个网站设计突变体引物的参数不需要修改吗?直接出来就可以合成吗?那么LB1.3引物的温度怎么计算啊?刚刚开始做这个,不是特别懂,希望指教,谢谢!...

直接出来合成就行了,不用算,根据你rp直接扩,只要你不设置那么离谱都能扩出来
7楼2016-10-11 09:44:34
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380939643mmm

铜虫 (初入文坛)

xn8008: 欢迎发帖交流 2016-10-11 13:36:18
引用回帖:
7楼: Originally posted by wx1308897716 at 2016-10-11 09:44:34
直接出来合成就行了,不用算,根据你rp直接扩,只要你不设置那么离谱都能扩出来...

好的, 我试试,再问下您,买到的拟南芥突变体种子以SALK开头,SALK_******(CF)/(AU)/(BU),SALK数字后边的括号里的(CF)/(AU)/(BU)分别代表什么意思?
8楼2016-10-11 10:40:14
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wx1308897716

木虫 (小有名气)

神虫

引用回帖:
8楼: Originally posted by 380939643mmm at 2016-10-11 10:40:14
好的, 我试试,再问下您,买到的拟南芥突变体种子以SALK开头,SALK_******(CF)/(AU)/(BU),SALK数字后边的括号里的(CF)/(AU)/(BU)分别代表什么意思?...

没太留意,我也不知道
9楼2016-10-11 14:26:15
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