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cheng910323

木虫 (小有名气)

[求助] 引物设计: 如何避开终止子 避免移码?求教帮修改下!!! 已有1人参与

R-Spe1R(3丶):        tagcta  ACTAGT  GTTCTTAGACTGCCAACAACCGTGC  这是我自己设计的引物  不知是否可以避开终止子避免移码现象?

目的基因后半段:AACTCGCAGAACCTTCCATTTGATCCCTCCAAGGCTGTTCCGCGTCTAACCCGTTGGGAA
        ATTGATCTCAATAGTGGTAACGATGAGATGAAACGTACGCAGCTACACGAATATTTTGCA
        GAAATGCCTATCATGGATTTCCGTTTTGCGCTCCAGGATCATCGCTACGCCTACATGGGG
        GTTGACGATCCTCGTCGCCCCTTAGCTCATCAGCAAGCTGAAAAAATCTTTGCCTACAAT
        TCGTTAGGGGTTTGGGACAACCATCGTAAAGATTATGAACTTTGGTTTACGGGAAAAATG
        TCTGCAGCGCAGGAACCGGCGTTTGTTCCTAGAAGCCCAGATGCGCCTGAGGGCGATGGC
        TACCTACTCAGTGTAGTAGGGCGGCTCGATGAAGATCGTAGCGATCTAGTTATCCTTGAT
        ACGCAATGTTTGGCAGCTGGGCCTGTGGCCACTGTCAAGCTTCCCTTCCGTCTCCGAGCA
        GCGTTGCACGGTTGTTGGCAGTCTAAGAACTGA             TGA 避开这个@biostar2009@飞约疯人院@wizardfan@youlinglyw
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不语
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cheng910323

木虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 781055707 at 2016-08-26 08:05:46
没看懂楼主要干什么

我设计的引物和这段基因的最后20几个碱基配对 我想知道 是否可以避开终止子TGA   以及避免移码突变。
不语
5楼2016-08-26 10:46:56
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cheng910323

木虫 (小有名气)


xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-08-26 08:44:51
补充一下 .这段引物是和下面目的基因匹配的!

发自小木虫Android客户端
不语
2楼2016-08-25 23:10:38
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781055707

木虫 (著名写手)


xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-08-26 08:44:58
没看懂楼主要干什么
采菊东篱下,悠然见南山。
3楼2016-08-26 08:05:46
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cheng910323

木虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 781055707 at 2016-08-26 08:05:46
没看懂楼主要干什么

R-Spe1R(3丶):        tagcta  ACTAGT  GTTCTTAGACTGCCAACAACCGTGC  这是我自己设计的引物  不知是否可以避开终止子避免移码现象? 后续有酶连接  表达蛋白 所以 担心移码 导致蛋白无法表达正常!

目的基因后半段:AACTCGCAGAACCTTCCATTTGATCCCTCCAAGGCTGTTCCGCGTCTAACCCGTTGGGAA
        ATTGATCTCAATAGTGGTAACGATGAGATGAAACGTACGCAGCTACACGAATATTTTGCA
        GAAATGCCTATCATGGATTTCCGTTTTGCGCTCCAGGATCATCGCTACGCCTACATGGGG
        GTTGACGATCCTCGTCGCCCCTTAGCTCATCAGCAAGCTGAAAAAATCTTTGCCTACAAT
        TCGTTAGGGGTTTGGGACAACCATCGTAAAGATTATGAACTTTGGTTTACGGGAAAAATG
        TCTGCAGCGCAGGAACCGGCGTTTGTTCCTAGAAGCCCAGATGCGCCTGAGGGCGATGGC
        TACCTACTCAGTGTAGTAGGGCGGCTCGATGAAGATCGTAGCGATCTAGTTATCCTTGAT
        ACGCAATGTTTGGCAGCTGGGCCTGTGGCCACTGTCAAGCTTCCCTTCCGTCTCCGAGCA
        GCGTTGCACGGTTGTTGGCAGTCTAAGAACTGA       避开最后这个TGA  终止子

     蓝色字体是引物匹配的碱基序列  红色的是终止子   酶切位点为SPE1:A  CTAGT

                                                                                                                 TGATC  A
不语
4楼2016-08-26 10:33:39
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