24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
南方科技大学公共卫生及应急管理学院2026级博士研究生招生报考通知(长期有效)
查看: 2733  |  回复: 9
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

寒冰利剑

金虫 (小有名气)

[交流] 启动子PCR

本人最近在克隆一个大小约2600bp的启动子,用的是NEB公司的phusion超保真酶,模板之前经过分段测序,有完整的序列,现在设计克隆全长启动子序列,测序发现中间部分序列存在较大程度与模板不匹配现象,启动子序列GC%平均在30%-40%,用phusion酶中的GC buffer,引物保证没有问题,不知道这是什么原因引起的,不知有没有虫友遇到过这种事情。有没有解决这种问题的方法,(到提供实用建议的,可追加金币,非诚勿扰)

发自小木虫Android客户端
回复此楼
岂能尽如人意,但求无愧我心。
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

werq63

金虫 (著名写手)


xn8008: 金币+1, 应助指数+1, 欢迎发帖交流 2016-08-21 07:40:11
你可以在中间设计一对引物,扩增一小段试试

发自小木虫Android客户端
3楼2016-08-21 00:50:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

werq63

金虫 (著名写手)

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-08-21 07:40:03
也有可能本身启动子就和你下载的序列不一样

发自小木虫Android客户端
2楼2016-08-21 00:49:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hanxiaominhu

至尊木虫 (著名写手)

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-08-21 21:51:30
之前的用的模板和后来用的模板是不是一样的,有没有可能是多态性。另外分段克隆的时候有没有可能产生错配。
4楼2016-08-21 09:34:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

寒冰利剑

金虫 (小有名气)


西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-08-21 21:51:45
模板不一样,但是同一种基因型的材料,分段克隆的序列都小于800bp,用的是一样的酶和反应体系,应该不会有错配。

发自小木虫Android客户端
岂能尽如人意,但求无愧我心。
5楼2016-08-21 18:46:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复(可上传附件)
信息提示
请填处理意见