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寒冰利剑

金虫 (小有名气)

[交流] 启动子PCR

本人最近在克隆一个大小约2600bp的启动子,用的是NEB公司的phusion超保真酶,模板之前经过分段测序,有完整的序列,现在设计克隆全长启动子序列,测序发现中间部分序列存在较大程度与模板不匹配现象,启动子序列GC%平均在30%-40%,用phusion酶中的GC buffer,引物保证没有问题,不知道这是什么原因引起的,不知有没有虫友遇到过这种事情。有没有解决这种问题的方法,(到提供实用建议的,可追加金币,非诚勿扰)

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岂能尽如人意,但求无愧我心。
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寒冰利剑

金虫 (小有名气)


西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-08-21 21:51:45
模板不一样,但是同一种基因型的材料,分段克隆的序列都小于800bp,用的是一样的酶和反应体系,应该不会有错配。

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5楼2016-08-21 18:46:51
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寒冰利剑

金虫 (小有名气)

phusion GC enhancer针对模板GC含量较高或较低,复杂度较高的序列,我们实验室扩增GC含量低的模板就用的这个buffer

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7楼2016-12-30 23:56:25
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寒冰利剑

金虫 (小有名气)

之前的问题,已经解决了,谢谢各位的关心

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9楼2017-01-01 00:06:41
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