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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » Lammps怎样读入多个data文件
汕头大学海洋科学接受调剂
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tina张

新虫 (小有名气)
送红花一朵
lz，问题解决了没有啊！最近我也被这个问题困扰
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不忘初心
11楼2016-09-24 09:57:28
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tina张

新虫 (小有名气)
送红花一朵
楼主，问题解决没有啊！我现在也遇到这问题，老提示Illegal read_data command,怎么改也不成
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不忘初心
12楼2016-09-24 16:57:38
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胜利笑哈哈

新虫 (小有名气)
引用回帖:
11楼: Originally posted by tina张 at 2016-09-24 09:57:28
lz，问题解决了没有啊！最近我也被这个问题困扰

我是加入了extra/atom/types/  命令，变正常了
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13楼2016-09-28 16:34:56
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tina张

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
7楼: Originally posted by KBzml at 2016-08-23 23:52:57
读第一个data要设置系统原子的type总数
...

你好，最近我被read_data这个命令困扰很久了，我要读进去的是两层水分子，in文件命令如下，现在也能读进去，但是会出现bond atom missing的错误，请问您知道这个问题如何解决么？万分感激！！
variable                      upwt   string up.data
read_data                     ${upwt}
group                         upwt   type 1 2
group                         oxygen type 1
variable                      mx     equal "lx*0"
variable                      my     equal "ly*0"
variable                      mz     equal "lz*0.5636"
displace_atoms                upwt move ${mx} ${my} ${mz} units box

variable                      belowwt     string below.data
read_data                     ${belowwt}  add append  offset 2 0 0 0 0
group                         belowwt     type 3 4
group                         oxygen      type 3
variable                      mxb         equal "lx*0"
variable                      myb         equal "ly*0"
variable                      mzb         equal "lz*0.2967"
displace_atoms                belowwt      move ${mxb} ${myb} ${mzb} units box
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不忘初心
14楼2016-11-26 11:35:55
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赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
13楼: Originally posted by 胜利笑哈哈 at 2016-09-28 16:34:56
我是加入了extra/atom/types/  命令，变正常了...

楼主，我最近在研究lammps连续读入两个data文件，老是出错。请指点。in文件里读取命令如下：
read_data   data1.multichains extra/atom/types 2  
read_data   data2.surface add append offset 0 0 0 0 0
两个data文件的atom type 完全不一样。data2里面有2种原子，原子与原子之间没有bond。

我的问题是：
1. data2里面原子类型编号是从1开始？还是接着data1的开始？  我设置从1 开始的，原子数目是读进去了，但是原子类型并没有变多。问题出在了哪里？
2. 提示我，ERROR: All masses are not set (../atom.cpp:1486)  这个mass的设置有什么特别的吗？
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15楼2017-07-03 09:54:31
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