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dazhuang509金虫 (小有名气)
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cp2k对NaCl的结构优化问题 已有1人参与
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dazhuang509
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2楼2016-08-10 11:15:07
朱全喜
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第一个问题没关系的,只要你测试得到稳定的结果那么用最小的那个RCUT就行;第二个问题是因为你设置的限制对称性和角度只是针对的晶胞参数,并没有涉及到原子之间的距离和角度关系(注意看你那两个参数是在CELL_OPTION);要输出键长键角你需要指定涉及到的那些原子在坐标文件中的序号然后输出(可以设置在GLOBAL SECTION print输出就行)。 发自小木虫Android客户端 |
3楼2016-08-10 21:59:08
dazhuang509
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4楼2016-08-11 09:58:37
朱全喜
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如果是固定键角键长那也就是想固定某些原子吧,你可以在MOTION模块下面的constraint模块fix进行设置,还是需要告诉原子在坐标文件中的序号给出list。 发自小木虫Android客户端 |
5楼2016-08-11 10:29:32
dazhuang509
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6楼2016-08-11 10:51:21












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这样相当于要固定一些原子吧。如果我只想让整个优化过程中都保持对称性应该怎样设置呢,因为按照我之前的设置,在27个原子组成的晶胞中,中心Na原子 和第一层Cl原子能够保证对称性和键角,但是在整个晶胞的面上就会有又畸变,角度变化而且不再同一平面上。