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jianjunjiang铁杆木虫 (正式写手)
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请问如何根据gromacs的结果计算均方位移（MSD） 已有1人参与
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各位大侠： 如题，利用gromacs可以计算出不同时刻原子的坐标，在计算均方位移（MSD）时，要计算出不同时刻某个粒子的位移（比如说ri（t）-ri(0)）； 但是有的时候好像又不能用计算出来的原始坐标直接相减；比如说某时刻原子x方向的坐标4,下一时刻为6,（假设盒子长度为6），此时计算该原子在x方向位移不能直接用6-4吧？ |
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2楼2016-08-03 06:27:13
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4楼2016-08-03 13:16:12
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6楼2016-08-03 21:21:01
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