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怡轩小住

新虫 (初入文坛)

[求助] 5‘RACE求助 已有1人参与



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想通过5'RACE克隆抗体基因可变区,用clontech的试剂盒做的,测序结果看到有扩增到V区,但是V区的头没有扩到(已经排除mRNA降解的可能性)
我推测可能是UPM-short primer与V区某个部位发生了错配,以至于头部丢失(图中UPM-S序列的后五位碱基AGGGC恰好与V区扩增到的最开始的几个碱基因重合),但奇怪的是在测序结果中,UPM-S前面一段序列恰好与SMARTer II oligo一致,这就很奇怪了,按照正常情况,SMARTer II应该在UPM-S的后面不是吗?而如果按照我前面的推测,UPM-short错配的话,在测序结果中应该看不到SMARTer II的。

求高手赐教这到底是咋 回事儿?

5‘RACE求助
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渊博震天

版主 (职业作家)

Yeast Display

优秀版主优秀版主

你这个问题确实很匪夷所思
5楼2018-06-27 08:32:52
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查看全部 6 个回答

杨柳依依625

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

前面的序列都是对的吗?会不会和其它基因错配了
2楼2016-11-03 15:22:09
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bffgbgff

新虫 (小有名气)

你好,请问您的问题解决了吗? 我做的RACE抗体测序是重链扩增不出条带,轻链可以扩增, 能不能告诉我一下您的GSP的引物序列?谢谢你!
3楼2018-06-27 06:49:54
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渊博震天

版主 (职业作家)

Yeast Display

优秀版主优秀版主

你这个问题确实很匪夷所思
4楼2018-06-27 08:32:41
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