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MS模拟分子动力学NPT系综中压力的设置问题 已有1人参与
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本人目前利用MS模拟计算聚合物的自由体积，主要是想解释关于气体渗透这一方面，但是目前在分子动力学这一步上有个疑问不知如何解决，就是我所计算的聚合物实测密度约1.4，到是我模拟出来的密度只有1.2几，模拟步骤首先是在1个大气压，298K下，进行1000ps的NPT，然后退火，接着再分别进行500ps的NPT和NVT。开始建了几个不通的模型，发现模拟出来的密度都比实测密度要小很多，然后我就尝试了在进行NPT分子动力学计算时，将压力由1个大气压分别提高到0.1Gpa，1Gpa和10Gpa进行尝试，发现模拟出来的密度终于大概接近了实测密度。现在比较纠结我这样的操作是否正确？NPT中这个压力的设置有没有什么硬性的要求，因为看了很多文献都是采用1个大气压进行模拟的。小弟基本是自学，没人带，现在是一脸懵逼，希望各位高手指导下到底如何操作，谢谢大家！ 发自小木虫Android客户端 |
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4楼2016-07-23 12:51:05
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2楼2016-07-23 00:37:50
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现在看别人的论文，他们最终模拟出来的密度和测试密度误差大部分是百分之一到百分之三，我现在算出来的误差有百分之十几，这样的话得最终得到的结果会不会不准确呢？ 发自小木虫Android客户端 |
3楼2016-07-23 09:25:51
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