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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 分子动力学计算矢量问题
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jianjunjiang

铁杆木虫 (正式写手)

[求助] 分子动力学计算矢量问题 已有1人参与

各位大侠：
               分子动力学计算过程中，在周期性边界条件下，如果要计算两个原子联线的矢量，要把两个原子x，y，z方向的坐标相减，如果在某一方向上，两个分量的差值大于盒子长度的一半，那么计算结果需不需要考虑周期性边界条件呢？
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1楼 2016-07-15 22:08:27
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jianjunjiang

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by brucefan at 2016-07-16 15:07:29
一般来说，分量差值是绝不会大于盒子长度的。其绝对值大于盒子长度一半时就要作修正。

谢谢
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6楼2016-07-16 18:28:32
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brucefan

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jianjunjiang: 金币+2 2016-07-16 14:17:16
分量差值绝对值大于盒子长度时要减去或者加上盒子长度。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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2楼2016-07-16 01:11:34
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jianjunjiang

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by brucefan at 2016-07-16 01:11:34
分量差值绝对值大于盒子长度时要减去或者加上盒子长度。

谢谢您的答复！那如果分量差值大于盒子长度一半，是不是也要处理呀，应为在周期性边界条件下，两原子的距离是小于盒子长度一半的
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3楼2016-07-16 14:16:07
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brucefan

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

我说错了。前一个盒子长度应该换成盒子长度一半。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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4楼2016-07-16 15:05:49
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