24小时热门版块排行榜    

查看: 1262  |  回复: 3

alex4388

新虫 (初入文坛)

[求助] PCR引物设计出现问题,无论怎么p都出不来 已有1人参与

实验室有人溶菌酶的一段基因,在载体pPIC9K上,溶菌酶序列后面加了两段GGGGS连接肽,后面还有一段多肽序列。

现在想要把多肽换成其他的12肽,可是设计引物的时候由于GGGGS(序列GGTGGTGGTGGTTCTGGTGGTGGTGGTTCC)的存在,怎么都p不出

也就是BamHI +人溶菌酶+GGGGSGGGGS+12肽+ECoRI的结构

前面的100个碱基

GGATCCAAACGATGAGATTTCCTTCAATTTTTACTGCAGTTTTATTCGCAGCATCCTCCGCATTAGCTGCTCCAGTCAACACTACAACAGAAGATGAAAC

尾巴的碱基

CGTTCGTCAATACGTCCAAGGTTGTGGTGTTGGTGGTGGTGGTTCTGGTGGTGGTGGTTCCTCTGGTGTTTACAAGGTTGCTTACGATTGGCAACACTAAGAATTC

求大神帮我设计方案了!!

跪谢!!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

976592787

木虫 (正式写手)

国家自然科学基金委员会委员长


西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-07-11 07:01:48
搞这么复杂干嘛,引物设计只要注意酶切位点和保护碱基的问题,连到什么样的载体,信号肽之类另说,只要引物差不多条件,模板上有这段基因pcr就一定p的出来

发自小木虫Android客户端
耻与众草之为伍,何亭亭而独芳!何不为人之所赏兮,深山穷谷委严霜。
2楼2016-07-10 13:38:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

alex4388

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 976592787 at 2016-07-10 13:38:19
搞这么复杂干嘛,引物设计只要注意酶切位点和保护碱基的问题,连到什么样的载体,信号肽之类另说,只要引物差不多条件,模板上有这段基因pcr就一定p的出来

由于G4S的存在,引物自身会形成发卡结构,每次测序都是最后几个bp发生了突变(在有效读长范围内)
3楼2016-07-10 16:31:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

不爱做实验

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引物自身发卡结构可通过提高退货温度得到一定程度解决
4楼2016-07-11 13:47:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 alex4388 的主题更新
信息提示
请填处理意见