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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】期待高人回答掺杂建模时如何建立√2×√2×2的超胞？
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ilyx8050

禁虫 (正式写手)
本帖内容被屏蔽
31楼2009-03-30 12:05:04
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syf0608

铁杆木虫 (小有名气)
继续顶~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
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32楼2009-05-07 10:25:48
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liuxiaocunde

铁杆木虫 (著名写手)

古德里安将军
顶起来·····················
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新征途
33楼2009-05-07 16:24:50
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材料小宝宝

新虫 (小有名气)
我也有这样的疑惑！
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34楼2009-05-15 16:15:43
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archhector

首先我有个疑问，当取非整数倍的晶格参数时，在类似castep的计算中如何满足周期性边界条件，因为你建立的一个边界和平移以后的边界条件是不同的。除非取了非整数倍的晶格参数时也出现了重复表面。相信大家有过对于简单结构建立带真空层的表面模型时程序自动在真空层顶层添加晶胞底面的情况。
考虑到dft的周期边界条件，如果这样的模型没有问题，我的拙见是该模型模拟了均匀掺杂，新建立的超原胞a，b，c应该是相等的。这样在周期性条件下，各个方向掺杂原子之间可以满足距离相等。
希望与大家讨论。
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35楼2009-05-15 17:37:36
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c111999

铜虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★
zdhlover(金币+4,VIP+0):谢谢你的热情回答，欢迎常理 6-16 02:38
在做掺杂建模计算时候如何建立√2×√2×2的超胞？为什么要建立这种超胞？建立这类超胞的原则是什么？希望高人给予解答
1.
√2= √2*distance between two nearest atoms in the same surface
√2×√2×2 means lattice vector a,b,c=√2,√2, 2 (2*distance between two layers)
You can draw such a box in the solid, in the box you will have atoms, which is the supercell.
2.
This is a way to a) generate certain fractional coverage on the surface, b)reduce the calculation time. e.g. if you have one atom absorbed on top of this √2×√2×2 supercell, you will have 1/2ML. This is much smaller (faster in CPU time) than if you have 2x2x2 supercell, you need 2 atoms to be absorbed on top of it to generate a 1/2ML.
3.
Try to reduce computational expense as much as possible by making use of non-integral sized supercell;
Try to generate special coverage (1/3, 1/5....).
The price you may pay for such supercells is the limited way to arrange absorption position, because you've reduced the supercell to some optimal size.


另外顺路问两个问题：1；在构造一个√3×√3的pt（111）表面U、V选取的原则？也就是U、V满足什么样的方向性和数值是如何确定的？
U.V you mean a,b (approx. x,y) vectors in the same surface?
If so, the directions of them follow the most densely packed direction of atoms (distance between two adjacent atoms is the smallest). For Pt 111, U,V should have 60 or 120 degree.
The amplitude of U,V are limited by your requirement of surface absorption requirement. E.g. you want a 1/4ML, you should have at least 2x2 surface with one absorption site.
2；在某个面上选取一个√2×√2×R45度的周期性之类胞的原则是怎么样确定的？
Sorry, do not understand this R45. If this is the angle between two surface vectors (√2×√2), then it means the way of packing is different from other surface. Just a guess.

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36楼2009-06-16 22:22:18
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honghans

木虫 (小有名气)

鸿渐
我也顶， 不明白！！
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supportemuch
37楼2009-06-17 22:44:59
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水月慧心

金虫 (正式写手)
顶起来！想弄明白
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38楼2009-06-19 10:05:05
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liyong.gan

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zdhlover(金币+3,VIP+0):非常感谢给出图示，能否给出根2*根2的图的示意图？ 6-22 15:43
引用回帖:
Originally posted by acridine at 2009-2-17 09:39:
说一下我的看法 应该不是输入1.414那么简单
比如平面上一个正方形的点阵,如果利用正方形两个边长作为基失建立晶胞,则可以称作(1×1)晶胞,如果利用正方形对角线作为基失建立晶胞就可以建立(√2×√2)

同意此观点~~~~~~~~我是做表面的，比如（√2X√2)（每层2个原子），我个人觉得是在{100}系列面上，是基矢方向是指向次近邻原子的，而次近邻原子间距是最近邻原子间的√2倍，此时就要改u，v的值了，这个稍微麻烦一点，几句话说不清楚，要自己通过立体几何去定义新的u、v值了……
我自己做了一个（√3X√3)的表面，每层3个原子，重新定义了u、v，个人觉得应该没有问题。

用不同的胞应该就是为了不同的浓度吧！

[ Last edited by liyong.gan on 2009-6-23 at 11:26 ]
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39楼2009-06-23 11:24:00
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zdhlover

荣誉版主 (职业作家)

小木虫之莲花佛
引用回帖:
Originally posted by liyong.gan at 2009-6-22 15:24:


同意此观点~~~~~~~~我是做表面的，比如（√2X√2)（每层2个原子），我个人觉得是在{100}系列面上，是基矢方向是指向次近邻原子的，而次近邻原子间距是最近邻原子间的√2倍，此时就要改u，v的值了，这个稍微麻 ...

具体的截面不一样，次近邻原子间距是不是是都是最近邻原子间的√2倍？根3倍的原子是哪个呢？
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40楼2009-06-23 11:45:59
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