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请教个问题:动力学模拟time step和number of steps 的关系 已有1人参与
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| 麻烦请教个问题:动力学模拟时设置time step=0.5fs number of steps=2000 则总模拟时间为1ps和设置time step=1fs number of steps=1000 则总模拟时间也为1ps,这两种设置有什么区别 哪个更精确呢,计算量哪个大一点,走的距离哪个远一点?谢谢! |
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分子动力学模拟 |
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brucefan
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5楼2016-06-22 18:24:43
brucefan
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【答案】应助回帖
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感谢参与,应助指数 +1
lisu555: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 好 谢谢 2016-06-22 08:56:56
感谢参与,应助指数 +1
lisu555: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 好 谢谢 2016-06-22 08:56:56
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A) time step=0.5fs number of steps=2000 则总模拟时间为1ps B) time step=1fs number of steps=1000 则总模拟时间也为1ps 哪个精度高一些? 一般来说设置A达到的精度高一些。 步长的设置主要依赖于体系的特征时间(频率)。 例如: 模拟argon(特征频率低),步长取到10fs都不会有什么问题; 模拟石墨烯(特征频率高),步长大于1fs就很危险了。 哪个计算量大? 计算量基本与number of steps成正比, 故设置A需要两倍于设置B的计算时间。 哪个走的“距离”远一点? 忽略计算误差的话,两个设置在物理上是等价的。 |
2楼2016-06-21 03:33:37
Ronny_chou
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4楼2016-06-22 17:01:23
6楼2016-06-23 00:08:23













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