24小时热门版块排行榜    

查看: 3321  |  回复: 9
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

lisu555

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] 请教个问题:动力学模拟time step和number of steps 的关系 已有1人参与

麻烦请教个问题:动力学模拟时设置time step=0.5fs  number of steps=2000 则总模拟时间为1ps和设置time step=1fs  number of steps=1000 则总模拟时间也为1ps,这两种设置有什么区别  哪个更精确呢,计算量哪个大一点,走的距离哪个远一点?谢谢!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Ronny_chou

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by brucefan at 2016-06-21 03:33:37
A) time step=0.5fs  number of steps=2000 则总模拟时间为1ps
B) time step=1fs  number of steps=1000 则总模拟时间也为1ps

哪个精度高一些?

一般来说设置A达到的精度高一些。
步长的设置主要依赖于体系 ...

那可不可以这样理解,保险的做法是把time step设小一点?
4楼2016-06-22 17:01:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

brucefan

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
lisu555: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 好 谢谢 2016-06-22 08:56:56
A) time step=0.5fs  number of steps=2000 则总模拟时间为1ps
B) time step=1fs  number of steps=1000 则总模拟时间也为1ps

哪个精度高一些?

一般来说设置A达到的精度高一些。
步长的设置主要依赖于体系的特征时间(频率)。
例如:
模拟argon(特征频率低),步长取到10fs都不会有什么问题;
模拟石墨烯(特征频率高),步长大于1fs就很危险了。

哪个计算量大?

计算量基本与number of steps成正比,
故设置A需要两倍于设置B的计算时间。

哪个走的“距离”远一点?

忽略计算误差的话,两个设置在物理上是等价的。
2楼2016-06-21 03:33:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

brucefan

专家顾问 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by Ronny_chou at 2016-06-22 17:01:23
那可不可以这样理解,保险的做法是把time step设小一点?...

可以这样说,但一般都用尽可能大的步长。谁也不想浪费计算资源。在NVE系综中做一个测试,如果总能相对涨落在十万分之一量级,步长就没问题。一般来说,步长越大,总能量涨落越大,计算越不精确。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
5楼2016-06-22 18:24:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lisu555

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by Ronny_chou at 2016-06-22 17:01:23
那可不可以这样理解,保险的做法是把time step设小一点?...

那一般是选择NVE还是 NVT系综呢,有什么依据吗?

发自小木虫Android客户端
6楼2016-06-23 00:08:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 4/200 2026-08-30 06:57 by ZPa0EcMwuECS
[硕博家园] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +4 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 5/250 2026-08-30 06:55 by ZPa0EcMwuECS
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 7/350 2026-08-30 06:43 by ZPa0EcMwuECS
[找工作] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 8/400 2026-08-30 05:51 by ZPa0EcMwuECS
[考博] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 4/200 2026-08-30 01:34 by ZPa0EcMwuECS
[公派出国] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 7/350 2026-08-30 01:12 by ZPa0EcMwuECS
[论文投稿] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +4 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 5/250 2026-08-30 01:03 by ZPa0EcMwuECS
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 5/250 2026-08-30 00:52 by ZPa0EcMwuECS
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 5/250 2026-08-30 00:41 by ZPa0EcMwuECS
[基金申请] 国社科申报系统有变化 +3 kynobel 2026-08-23 3/150 2026-08-29 21:57 by 余韵清
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +5 德尚中行 2026-08-27 6/300 2026-08-29 18:10 by manplx
[基金申请] 为什么到现在没收到通知? +4 tannykie 2026-08-29 4/200 2026-08-29 17:14 by lmz0216
[教师之家] 导师吐槽:我怎么摊上了这么个极品研究生! +9 苏东坡二世 2026-08-23 9/450 2026-08-29 14:41 by hustersqt
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
[基金申请] 我就是申请一个面上项目而已,这评审意见是按照杰青的条件评的吧? +6 gouxfjh 2026-08-28 9/450 2026-08-29 09:59 by jklily
[基金申请] 怎么查啊 +6 huang1991js 2026-08-26 6/300 2026-08-28 08:42 by winsaint
[基金申请] 申请删除本帖 +6 lyz123lyz 2026-08-27 7/350 2026-08-27 17:31 by 宁静致远sy
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +7 process2012 2026-08-23 10/500 2026-08-26 19:23 by hmhminy
[基金申请] 国际合作可查了,中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑,不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
信息提示
请填处理意见