24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 3039  |  回复: 9
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

lisu555

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] 请教个问题:动力学模拟time step和number of steps 的关系 已有1人参与

麻烦请教个问题:动力学模拟时设置time step=0.5fs  number of steps=2000 则总模拟时间为1ps和设置time step=1fs  number of steps=1000 则总模拟时间也为1ps,这两种设置有什么区别  哪个更精确呢,计算量哪个大一点,走的距离哪个远一点?谢谢!
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

分子动力学模拟

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Ronny_chou

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by brucefan at 2016-06-21 03:33:37
A) time step=0.5fs  number of steps=2000 则总模拟时间为1ps
B) time step=1fs  number of steps=1000 则总模拟时间也为1ps

哪个精度高一些?

一般来说设置A达到的精度高一些。
步长的设置主要依赖于体系 ...

那可不可以这样理解,保险的做法是把time step设小一点?
4楼2016-06-22 17:01:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

brucefan

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
lisu555: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 好 谢谢 2016-06-22 08:56:56
A) time step=0.5fs  number of steps=2000 则总模拟时间为1ps
B) time step=1fs  number of steps=1000 则总模拟时间也为1ps

哪个精度高一些?

一般来说设置A达到的精度高一些。
步长的设置主要依赖于体系的特征时间(频率)。
例如:
模拟argon(特征频率低),步长取到10fs都不会有什么问题;
模拟石墨烯(特征频率高),步长大于1fs就很危险了。

哪个计算量大?

计算量基本与number of steps成正比,
故设置A需要两倍于设置B的计算时间。

哪个走的“距离”远一点?

忽略计算误差的话,两个设置在物理上是等价的。
2楼2016-06-21 03:33:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

brucefan

专家顾问 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by Ronny_chou at 2016-06-22 17:01:23
那可不可以这样理解,保险的做法是把time step设小一点?...

可以这样说,但一般都用尽可能大的步长。谁也不想浪费计算资源。在NVE系综中做一个测试,如果总能相对涨落在十万分之一量级,步长就没问题。一般来说,步长越大,总能量涨落越大,计算越不精确。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
5楼2016-06-22 18:24:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lisu555

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by Ronny_chou at 2016-06-22 17:01:23
那可不可以这样理解,保险的做法是把time step设小一点?...

那一般是选择NVE还是 NVT系综呢,有什么依据吗?

发自小木虫Android客户端
6楼2016-06-23 00:08:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 化学调剂 +3 爱吃番茄的旭 2026-03-24 4/200 2026-03-27 15:43 by shangxh
[考研] 求调剂推荐 材料 304 +12 荷包蛋hyj 2026-03-26 12/600 2026-03-27 14:46 by laoshidan
[考研] 299求调剂 +6 嗯嗯嗯嗯2 2026-03-27 6/300 2026-03-27 12:43 by 果果妈咪
[考研] 0856材料专硕353求调剂 +9 NIFFFfff 2026-03-20 9/450 2026-03-27 10:13 by dick_runner
[考研] 一志愿郑州大学,080500学硕,总分317分求调剂 +4 举个栗子oi 2026-03-24 5/250 2026-03-26 23:15 by 不吃魚的貓
[考研] 071000生物学求调剂,初试成绩343 +6 小小甜面团 2026-03-25 6/300 2026-03-26 23:01 by 不吃魚的貓
[考研] 一志愿华理,数一英一285求A区调剂 +8 AZMK 2026-03-25 10/500 2026-03-26 22:37 by 学员8dgXkO
[考研] 085602 289分求调剂 +8 WWW西西弗斯 2026-03-24 8/400 2026-03-26 16:33 by 不吃魚的貓
[考研] 寻找调剂 +5 倔强芒? 2026-03-21 8/400 2026-03-26 13:25 by 0906ljy
[考研] 309求调剂 +4 gajsj 2026-03-25 5/250 2026-03-26 00:27 by Dyhoer
[考研] 332求调剂 +6 032500 2026-03-25 6/300 2026-03-25 22:45 by 418490947
[考研] 网络空间安全0839招调剂 +4 w320357296 2026-03-25 6/300 2026-03-25 17:59 by 255671
[考研] 一志愿南航材料专317分求调剂 +5 炸呀炸呀炸薯条 2026-03-23 5/250 2026-03-24 16:52 by 星空星月
[考研] 求调剂 +7 十三加油 2026-03-21 7/350 2026-03-23 23:48 by 热情沙漠
[考研] 材料/农业专业,07/08开头均可,过线就行 +3 呵唔哦豁 2026-03-23 4/200 2026-03-23 22:30 by 汪!?!
[考研] 一志愿重庆大学085700资源与环境,总分308求调剂 +7 墨墨漠 2026-03-23 8/400 2026-03-23 20:36 by Creta
[论文投稿] 急发核心期刊论文 +3 贤达问津 2026-03-23 5/250 2026-03-23 17:13 by 妹子不好惹
[考研] 297求调剂 +3 喜欢还是不甘心 2026-03-20 3/150 2026-03-21 18:33 by 学员8dgXkO
[考研] 336求调剂 +5 rmc8866 2026-03-21 5/250 2026-03-21 17:24 by 学员8dgXkO
[考研] 332求调剂 +3 凤凰院丁真 2026-03-20 3/150 2026-03-21 10:27 by luoyongfeng
信息提示
请填处理意见