Yes, I use matlab, C/C++, and CUDA (for graphics processing units) in my research.
Sorry, I know nothing about "桥氧,非桥氧与自由氧". Molecular dynamics simulation
is a very broad subject, and I am only working on mechanical and thermal properties of
materials.
怎么说那?你理解的扩散系数我认为是有点点问题的。尽管看公式的话是这个意思,但是这毕竟是一个统计过程,所以,应该是多次统计后去平均值吧!你在计算是要考虑模拟系统的大小吧?也就说统计的时间不应该足够的大。因为这个均方位移必须是有界的。具体的,你可以参考《The Art of Molecular Dynamics Simulation》的第五章。有详细的讨论。至于扩散系数会达到一个稳定值。若你的数据简单拟合的话。应该5-45之间的就行,建议你好好读读这本书的第五章。