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wangxu1017银虫 (初入文坛)
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基因组未知基因验证 已有3人参与
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各位大虾： 本人通过二代测序获得一株食品中分离的单增李斯特菌(食源性致病菌，革兰氏阳性菌)基因组，通过比较基因组比对发现3个基因组岛含有假定蛋白并没有在其他细菌中发现，请问如何鉴定这个基因？是否要进行蛋白质组学确定有基因功能，或者更简便的方法确定其有蛋白质功能，还是直接进行敲除实验？谢谢 |
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原海亮
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【答案】应助回帖
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wangxu1017: 金币+3, ★★★很有帮助 2016-06-06 15:07:09
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wangxu1017: 金币+3, ★★★很有帮助 2016-06-06 15:07:09
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通常的思维逻辑是这样的，分子生物学上通常是，参考比对序列同源性较高的已知序列，推测酶功能，也就是你做的基因组比对，接下来从两个大方面可以进行，一个是体内验证，也就是你说的基因敲除，当然还有敲除后的基因回补，这可以在原始菌株内验证其真实功能；另一个是体外验证，即做异源表达来纯化获得该基因的蛋白，在体外进行蛋白功能研究。最后其他学科方向都会有不同的研究方式，蛋白组学，生物信息学，生物转化等等，对于没有思路的，个人觉得参考现有的相似蛋白研究成果是必要的，祝好！！ 发自小木虫Android客户端 |
2楼2016-06-05 08:17:09
wangxu1017
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