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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 径向分布函数。求大神指点迷津
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保罗VS帕克

铁虫 (初入文坛)

[求助] 径向分布函数。求大神指点迷津 已有1人参与

用gulp模块跑分子动力学，然后用forcite模块分析轨迹文件的径向分布函数，出现以下情形。为什么会出现直线凸起？解决办法是什么。谢谢啦

径向分布函数。求大神指点迷津
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今天，你好
1楼 2016-05-24 14:36:36
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abinitio

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by 保罗VS帕克 at 2016-05-24 16:08:50
我是指后面的两个竖线凸起，不是前面的峰。正常不应该有这种直上直下的竖线。请问这种情况能解决吗？...

我知道你问的后面的两条竖线。
如果是个完美晶体，rdf应该是在相应的位置出现这种竖线。而前面的漫高峰，应该是一种非周期性结构。所以我才问，是不是没有完全熔化？
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4楼2016-05-24 16:17:40
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abinitio

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
保罗VS帕克(月只蓝代发): 金币+3, 感谢指导！ 2016-05-24 15:55:41
一般这种突起说明是有周期性结构出现，如果是在做  熔化过程，是不是没有完全熔化？
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2楼2016-05-24 15:07:46
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保罗VS帕克

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by abinitio at 2016-05-24 15:07:46
一般这种突起说明是有周期性结构出现，如果是在做  熔化过程，是不是没有完全熔化？

我是指后面的两个竖线凸起，不是前面的峰。正常不应该有这种直上直下的竖线。请问这种情况能解决吗？
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今天，你好
3楼2016-05-24 16:08:50
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保罗VS帕克

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by abinitio at 2016-05-24 16:17:40
我知道你问的后面的两条竖线。
如果是个完美晶体，rdf应该是在相应的位置出现这种竖线。而前面的漫高峰，应该是一种非周期性结构。所以我才问，是不是没有完全熔化？...

哦哦，我在做Fe的熔化，用npt系宗时，RDF不会出现这种情况，但是NPT不能再跑完的构型上进行下一步操作。（构型不稳定）。所以想用nvt系宗，但是用nvt系宗升温到2800k时，rdf都是有多个峰，呈现晶体结构特征。而且会有竖线，不知道怎么解释。没有完全融合的金属rdf会有这种竖线？
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今天，你好
5楼2016-05-24 17:07:37
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