应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » (cooch3)2 优化结构 刚接触，不知道是结构式出错还是？？？
51/1返回列表
查看: 2439  |  回复: 10
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

byyd

金虫 (小有名气)

[求助] (cooch3)2 优化结构 刚接触，不知道是结构式出错还是？？？ 已有2人参与

%rwf=a1,40gb,a2,20gb
%nosave
%chk=test.chk
%mem=50GB
%nprocshared=12
# B3LYP/6-311+g(2d,p) opt=(MaxCycle=500)
       。。。。。。

radGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGrad
Berny optimization.
Using GEDIIS/GDIIS optimizer.
NTrRot=    -1 NTRed=   124 NAtoms=    14 NSkip=    88 IsLin=F
Error in internal coordinate system.
Error termination via Lnk1e in /data2/G09/g09/l103.exe at Mon May 16 12:25:19 2016.
Job cpu time:  0 days  6 hours 17 minutes 55.0 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=     37 Int=      0 D2E=      0 Chk=      5 Scr=      1(cooch3)2 优化结构  刚接触，不知道是结构式出错还是？？？
Y.png
回复此楼

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : cooch32.log
    • 2016-05-16 16:29:52, 2.74 M

» 猜你喜欢
1楼 2016-05-16 16:32:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

byyd

金虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 三石草祭 at 2016-05-17 15:26:19
建议先clean用力场初步优化结构

刚接触，不知道怎么弄，我用重新画啦下图，我在试试看
赞一下 回复此楼
7楼2016-05-17 16:48:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答

zhou2009

版主 (著名写手)
看了你log文件分子输入坐标，完全不正确，原子定位不正确，两个CH3连到羰基O上了，不是你预想的结构。要重新拟定。
赞一下 回复此楼
2楼2016-05-16 17:57:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

byyd

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhou2009 at 2016-05-16 17:57:56
看了你log文件分子输入坐标，完全不正确，原子定位不正确，两个CH3连到羰基O上了，不是你预想的结构。要重新拟定。

能麻烦你给个正确的不？我问了下学化学的同学，他们说没错～～～

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
3楼2016-05-16 19:28:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
引用回帖:
3楼: Originally posted by byyd at 2016-05-16 19:28:31
能麻烦你给个正确的不？我问了下学化学的同学，他们说没错～～～
...

你的结构应该没错，如果这是HOOC-COOH与两个CH3OH脂化得到的话。
问题是你画的结构有问题，羧基中的OCO并不是直角，你用GV画一个羧基就知道了。
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2016-05-17 12:34:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 5/250 2026-08-29 21:44 by 4qO8zhfjr2AX
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+15) +15 晴天加油 2026-08-26 16/800 2026-08-29 18:28 by symmetry
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +5 德尚中行 2026-08-27 6/300 2026-08-29 18:10 by manplx
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 8/400 2026-08-29 17:22 by 4FFAWE8HcgUD
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见（F口面上） +5 gdd2018 2026-08-28 10/500 2026-08-29 14:10 by Jacob678
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +5 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 9/450 2026-08-29 14:03 by jCd0dEvKHShX
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 4/200 2026-08-29 14:02 by jCd0dEvKHShX
[找工作] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 6/300 2026-08-29 11:29 by jCd0dEvKHShX
[考研] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +6 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 9/450 2026-08-29 11:18 by jCd0dEvKHShX
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +4 bud_bud 2026-08-27 7/350 2026-08-29 07:23 by foolishmani
[基金申请] 基金不中，共勉 +11 eulota 2026-08-26 11/550 2026-08-28 14:22 by 火星超人xi
[基金申请] 面上合作单位盖章 +5 ssyjh 2026-08-27 5/250 2026-08-27 20:50 by gdfollow
[基金申请] 申请删除本帖 +6 lyz123lyz 2026-08-27 7/350 2026-08-27 17:31 by 宁静致远sy
[基金申请] 基金未中，这种答复是模板吗？ +5 zhaosm1982 2026-08-27 6/300 2026-08-27 16:00 by lfy8008
[文学芳草园] 梦想 +3 myrtle 2026-08-26 3/150 2026-08-27 10:01 by angelyueyi
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 国际合作可查了，中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 今天务委会开完了，明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[基金申请] 牛来！米来！面来！ +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭