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siesta运行出错exited on signal 11 (Segmentation fault)
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SystemName hydroxyapatite SystemLabel hap NumberOfAtoms 352 NumberOfSpecies 4 %block ChemicalSpeciesLabel 1 8 O 2 15 P 3 20 Ca 4 1 H %endblock ChemicalSpeciesLabel PAO.BasisSize DZP PAO.EnergyShift 300 meV PAO.SplitNorm 0.23 LatticeConstant 1 Ang %block LatticeVectors 18.8480 0.000 0.000 0.000 18.8480 0.000 0.000 0.000 46.2861 %endblock LatticeVectors %block kgrid_Monkhorst_Pack 2 0 0 0.0 0 2 0 0.0 0 0 2 0.0 %endblock kgrid_Monkhorst_Pack XC.functional GGA # Exchange-correlation functional XC.authors PBE # Exchange-correlation version SpinPolarized F #WriteMullikenPop 3 MeshCutoff 250.0 Ry MM.Grimme.S6 0.76 MM.Grimme.D 20.0 MaxSCFIterations 50 DM.NumberPulay 3 DM.Tolerance 1.d-4 SolutionMethod diagon #ElectronicTemperature 25 meV MD.TypeOfRun CG MD.NumCGsteps 100 MD.MaxCGDispl 0.1 Ang MD.MaxForceTol 0.04 eV/Ang MD.VariableCell T AtomicCoordinatesFormat Ang %block AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies 11.367699975 0.484282000 0.696987232 1 1 O1 7.862918746 0.484282000 3.951755314 1 2 O2 12.434021203 0.484282000 5.359600851 1 3 O3 14.454058500 3.923782000 3.254768083 1 4 O4 17.958839729 3.923782000 -0.000000000 1 5 O5 14.454058500 6.394718000 3.254768083 1 6 O6 17.958839729 6.394718000 0.000000000 1 7 O7 11.367699975 2.955218000 0.696987232 1 8 O8 7.862918746 2.955218000 3.951755314 1 9 O9 12.434021203 2.955218000 5.359600851 1 10 O10 13.575269974 1.719750000 0.573747231 1 11 O11 12.170149975 1.719750000 2.690817232 1 12 O12 12.148949974 1.719750000 1.145857232 1 13 O13 6.652404776 1.719750000 2.101563614 1 14 O14 9.188401177 1.719750000 2.259898229 2 15 P1 7.861026569 1.719750000 3.050737968 3 16 Ca1 11.436965174 1.719750000 7.333032552 1 17 O15 10.306088773 1.719750000 5.057627936 1 18 O16 11.654663380 1.719750000 5.811748198 2 19 P2 14.137880778 1.719750000 3.988489499 3 20 Ca2 12.246488500 5.159250000 3.378008083 1 21 O17 13.651608500 5.159250000 1.260938083 1 22 O18 13.672808500 5.159250000 2.805898083 2 23 P3 7.069408501 5.159250000 4.044798083 3 24 Ca3 19.169353700 5.159250000 1.850191701 1 25 O19 16.633357298 5.159250000 1.691857085 1 26 O20 17.960731906 5.159250000 0.901017347 2 27 P4 12.911353728 5.159250000 6.000279498 3 28 Ca4 15.266878500 0.008942700 0.615640849 1 29 O21 10.554879975 3.448442700 3.336114465 1 30 O22 %endblock AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies 这是我的输入文件 加了真空层的 每次提交任务后都会出现错误mpirun noticed that process rank 1 with PID 10294 on node node241 exited on signal 11 (Segmentation fault). 哪位可以指点一下谢谢了 新手刚开始学拜托拜托了 |
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