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li李晓晓

新虫 (初入文坛)

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[求助] 关于MS建模已有1人参与

需要RDX、HMX、TATB的CIF文件，我可以怎么找到或者有没有朋友有现成的可以发我呢？我还有一个疑问就是我们在做分子动力学计算建模时只能根据CIF文件建模吗，有没有其他方法？

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1楼 2016-05-10 20:44:04

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

月只蓝

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【答案】应助回帖

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li李晓晓: 金币+5, ★★★很有帮助 2016-05-11 10:41:40

引用回帖:

5楼: Originally posted by li李晓晓 at 2016-05-11 10:02:43
我画的是晶胞，晶胞参数我是通过文献找来的（点群之类），然后我用MS画一个分子，直接通过Build-Crystals输入参数这么来得到晶胞，或者是画一个晶胞把分子复制进来，师兄说只能通过先画晶胞然后添加原子的形式，这 ...

构建晶体，你这样的做法肯定是错误的。
晶体的各种参数，都是有专门的数据库供查找的。
无机晶体，常用 ICSD数据库；有机晶体，常用CCDC数据库。
在这些数据库中，找到想要晶体的信息之后，有两种方式建模：
一种，直接导出cif文件，导入到MS中，检查导入无误，即可；
另一种，在MS中build crystal，手动输入空间群、6个晶格常数，再 add atoms 输入各原子坐标，即可完成。