24小时热门版块排行榜    

查看: 1927  |  回复: 13
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

li李晓晓

新虫 (初入文坛)

[求助] 关于MS建模 已有1人参与

需要RDX、HMX、TATB的CIF文件,我可以怎么找到或者有没有朋友有现成的可以发我呢?我还有一个疑问就是我们在做分子动力学计算建模时只能根据CIF文件建模吗,有没有其他方法?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

li李晓晓

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 月只蓝 at 2016-05-11 09:35:42
首先你得明确,你要建立的模型是不是晶体,如果是晶体,那得找到文献发表的晶体数据来建模。
如果不是晶体,而是分子形式的,MS直接画即可,不存在坐标的准确性问题。...

我画的是晶胞,晶胞参数我是通过文献找来的(点群之类),然后我用MS画一个分子,直接通过Build-Crystals输入参数这么来得到晶胞,或者是画一个晶胞把分子复制进来,师兄说只能通过先画晶胞然后添加原子的形式,这样就得需要每个原子的具体坐标。
5楼2016-05-11 10:02:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 14 个回答

月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
这种分子结构,MS里面可以直接画的。
导入cif就能完成步骤的情况是少数,多数还是需要MS中的操作。
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助!时间精力有限,恕不接受无偿私信求助。
2楼2016-05-10 21:42:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

li李晓晓

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 月只蓝 at 2016-05-10 21:42:23
这种分子结构,MS里面可以直接画的。
导入cif就能完成步骤的情况是少数,多数还是需要MS中的操作。

我是在MS里面直接画的,但是师兄说不准确,不能确定它的具体坐标
3楼2016-05-11 09:17:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by li李晓晓 at 2016-05-11 09:17:30
我是在MS里面直接画的,但是师兄说不准确,不能确定它的具体坐标...

首先你得明确,你要建立的模型是不是晶体,如果是晶体,那得找到文献发表的晶体数据来建模。
如果不是晶体,而是分子形式的,MS直接画即可,不存在坐标的准确性问题。
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助!时间精力有限,恕不接受无偿私信求助。
4楼2016-05-11 09:35:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 3/150 2026-08-29 21:35 by 4qO8zhfjr2AX
[找工作] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 5/250 2026-08-29 21:33 by 4qO8zhfjr2AX
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+15) +15 晴天加油 2026-08-26 16/800 2026-08-29 18:28 by symmetry
[基金申请] 为什么到现在没收到通知? +4 tannykie 2026-08-29 4/200 2026-08-29 17:14 by lmz0216
[论文投稿] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 4/200 2026-08-29 14:13 by jCd0dEvKHShX
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 5/250 2026-08-29 11:49 by jCd0dEvKHShX
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
[教师之家] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 7/350 2026-08-29 09:26 by G6APbkg8SA6w
[基金申请] 基金不中,共勉 +11 eulota 2026-08-26 11/550 2026-08-28 14:22 by 火星超人xi
[基金申请] 怎么查啊 +6 huang1991js 2026-08-26 6/300 2026-08-28 08:42 by winsaint
[基金申请] 面上合作单位盖章 +5 ssyjh 2026-08-27 5/250 2026-08-27 20:50 by gdfollow
[基金申请] 我不理解! +15 Edward_pc 2026-08-26 23/1150 2026-08-26 20:34 by zzuzxg
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 国际合作可查了,中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 国合现在查不到了吗? +10 chengyan1220 2026-08-24 20/1000 2026-08-26 08:57 by peasantsprig
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候,我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑,不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
信息提示
请填处理意见