应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 计算模拟 » 其他 » 过渡态计算
51/1返回列表
查看: 1481  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

康老师

铜虫 (小有名气)

[求助] 过渡态计算

跪求！利用VASP计算过渡态，之后确定过渡态，计算了频率，但是出现了多个虚频，这样正常吗？
回复此楼

» 猜你喜欢
wherethereisawill，thereisaway
1楼 2016-05-06 16:07:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

笑然49

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by hakuna at 2016-05-29 06:53:17
说明没有收敛到过渡态，你可以以此为基础继续搜...

非常感谢您的答复，我想问一下怎么以此为基础再次搜索过渡态呀？我用的是CI-NEB方法，确定初态和末态后会自动搜索出过渡态，如何利用这个结果再次搜索呢？
赞一下 回复此楼
smile
5楼2016-05-29 20:46:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

hakuna

木虫 (知名作家)
不正常
过渡态有且只有一个虚频，并且虚频对应的振动模式与成键或断键原子移动方向一致
赞一下(2人) 回复此楼
2楼2016-05-14 23:29:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

笑然49

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by hakuna at 2016-05-14 23:29:37
不正常
过渡态有且只有一个虚频，并且虚频对应的振动模式与成键或断键原子移动方向一致

你好，我对过渡态进行频率验证，怎么会出现两个虚频呢，求解答
1 f  =   68.023389 THz   427.403561 2PiTHz 2269.015966 cm-1   281.322227 meV
             X         Y         Z           dx          dy          dz
      5.947772  0.000000  0.008558            0           0           0  
      1.489083  1.539659  1.489083            0           0           0  
      2.986723  0.000000  0.008558            0           0           0  
      4.467248  1.566974  1.489083            0           0           0  
      5.942158  3.065663  0.014172            0           0           0  
      1.489083  4.591666  1.489083            0           0           0  
      2.992338  3.065663  0.014172            0           0           0  
      4.467248  4.564351  1.489083            0           0           0  
      5.947772  0.000000  2.969607            0           0           0  
      1.489083  1.367472  4.467248            0           0           0  
      2.986723  0.000000  2.969607            0           0           0  
      4.467248  1.539659  4.467248            0           0           0  
      5.942158  3.065663  2.963993            0           0           0  
      1.489083  4.763853  4.467248            0           0           0  
      2.992338  3.065663  2.963993            0           0           0  
      4.467248  4.591666  4.467248            0           0           0  
      1.489083  3.065663  4.467248    -0.000005   -1.000000   -0.000435  

   2 f/i=   17.703901 THz   111.236893 2PiTHz  590.538565 cm-1    73.217477 meV
             X         Y         Z           dx          dy          dz
      5.947772  0.000000  0.008558            0           0           0  
      1.489083  1.539659  1.489083            0           0           0  
      2.986723  0.000000  0.008558            0           0           0  
      4.467248  1.566974  1.489083            0           0           0  
      5.942158  3.065663  0.014172            0           0           0  
      1.489083  4.591666  1.489083            0           0           0  
      2.992338  3.065663  0.014172            0           0           0  
      4.467248  4.564351  1.489083            0           0           0  
      5.947772  0.000000  2.969607            0           0           0  
      1.489083  1.367472  4.467248            0           0           0  
      2.986723  0.000000  2.969607            0           0           0  
      4.467248  1.539659  4.467248            0           0           0  
      5.942158  3.065663  2.963993            0           0           0  
      1.489083  4.763853  4.467248            0           0           0  
      2.992338  3.065663  2.963993            0           0           0  
      4.467248  4.591666  4.467248            0           0           0  
      1.489083  3.065663  4.467248     0.999999   -0.000005   -0.001571  

   3 f/i=   17.728309 THz   111.390251 2PiTHz  591.352721 cm-1    73.318419 meV
             X         Y         Z           dx          dy          dz
      5.947772  0.000000  0.008558            0           0           0  
      1.489083  1.539659  1.489083            0           0           0  
      2.986723  0.000000  0.008558            0           0           0  
      4.467248  1.566974  1.489083            0           0           0  
      5.942158  3.065663  0.014172            0           0           0  
      1.489083  4.591666  1.489083            0           0           0  
      2.992338  3.065663  0.014172            0           0           0  
      4.467248  4.564351  1.489083            0           0           0  
      5.947772  0.000000  2.969607            0           0           0  
      1.489083  1.367472  4.467248            0           0           0  
      2.986723  0.000000  2.969607            0           0           0  
      4.467248  1.539659  4.467248            0           0           0  
      5.942158  3.065663  2.963993            0           0           0  
      1.489083  4.763853  4.467248            0           0           0  
      2.992338  3.065663  2.963993            0           0           0  
      4.467248  4.591666  4.467248            0           0           0  
      1.489083  3.065663  4.467248     0.001571   -0.000435    0.999999
赞一下 回复此楼
smile
3楼2016-05-27 11:12:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hakuna

木虫 (知名作家)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 笑然49 at 2016-05-27 11:12:04
你好，我对过渡态进行频率验证，怎么会出现两个虚频呢，求解答
1 f  =   68.023389 THz   427.403561 2PiTHz 2269.015966 cm-1   281.322227 meV
             X         Y         Z           dx          d ...

说明没有收敛到过渡态，你可以以此为基础继续搜
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2016-05-29 06:53:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭