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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 客体与环糊精形成氢键的位置
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6309155

新虫 (小有名气)
送红花一朵
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10楼: Originally posted by zhou2009 at 2016-05-06 16:11:07
环糊精上O形成氢键的可能性大些。
从你附的图看，O形成氢键的孤对电子是垂直于纸平面的，应在这个方向形成氢键。
与N-H形成氢键的可能性大一些。

嗯了，环糊精大端不是有两种氧么，一种市仲羟基上的氧O1，另外一种就是旁边的氧O2（也就是我这个图上的这个氧），我的意思是一般文章中说客体和环糊精发生相互作用形成氢键，好像指的都是和仲羟基上的氧，像我遇到的O2类的氢键，能否也算客体跟环糊精发生相互作用的一种表现了？

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11楼2016-05-06 20:53:38
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不取俗名

木虫 (正式写手)
可以算个AIM，看看是否有bcp，再看看电子密度在不在氢键的范围呢

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12楼2016-05-07 00:18:58
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6309155

新虫 (小有名气)
引用回帖:
12楼: Originally posted by 不取俗名 at 2016-05-07 00:18:58
可以算个AIM，看看是否有bcp，再看看电子密度在不在氢键的范围呢

请问怎么算AIM,看那个cbp?我没接触过这个，可以具体点不？

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13楼2016-05-07 06:28:42
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不取俗名

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
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13楼: Originally posted by 6309155 at 2016-05-07 06:28:42
请问怎么算AIM,看那个cbp?我没接触过这个，可以具体点不？
...

先用高斯算wfn文件，然后用别的软件，很多波函数处理软件都可以，进行拓朴分析

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14楼2016-05-07 09:40:34
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6309155

新虫 (小有名气)
引用回帖:
14楼: Originally posted by 不取俗名 at 2016-05-07 09:40:34
先用高斯算wfn文件，然后用别的软件，很多波函数处理软件都可以，进行拓朴分析
...

可以用multiwfn软件吗？能具体说一点点么。我刚接触这个软件？

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15楼2016-05-09 09:07:01
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不取俗名

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
15楼: Originally posted by 6309155 at 2016-05-09 09:07:01
可以用multiwfn软件吗？能具体说一点点么。我刚接触这个软件？
...

mulitwfn可以，sob老师的博文有写，去搜索一下

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16楼2016-05-09 13:22:43
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