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gromacs5.1在服务器上的安装问题 已有2人参与
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楼主是linux和gromacs双料小白，很不幸要摸索如何在服务器上以普通用户安装gmx-5.1（同时服务器/usr/local/gromacs 已经存在一个4.6版本的GMX） 我在自己的home目录下下载并解压了gmx-5.1 tar xfz gromacs-5.1.2.tar.gz cd gromacs-5.1.2 mkdir build cd build cmake .. -DCAME_INSTALL_PREFIX=/home/user/xncao/sy/gromacs/gromacs-5.1.2 -DGMX_MPI=ON -DGMX_BUILD_OWN_FFTW=ON make -j make install 一直到make -j都没有什么问题，如下： [xncao@login_node build]$ make -j [ 1%] Built target fftwBuild [ 1%] Built target view_objlib [ 1%] Built target mdrun_objlib [ 98%] Built target libgromacs [100%] [100%] Built target gmx Built target template [xncao@login_node build]$ 但是make install以后就有如下报错： [xncao@login_node build]$ make install [ 1%] Built target fftwBuild [ 98%] Built target libgromacs [100%] Built target template [100%] Built target mdrun_objlib [100%] Built target view_objlib [100%] Built target gmx Install the project... -- Install configuration: "Release" -- Installing: /usr/local/gromacs/share/gromacs/COPYING CMake Error at cmake_install.cmake:36 (FILE): file INSTALL cannot copy file "/home/user/xncao/sy/gromacs/gromacs-5.1.2/COPYING" to "/usr/local/gromacs/share/gromacs/COPYING". make: *** [install] Error 1 我试图删除或者手动替换/usr/local/gromacs/share/gromacs目录中的COPYING，但是并没有权限。。。 求问大家：1.我已经使用 -DCAME_INSTALL_PREFIX=/home/user/xncao/sy/gromacs/gromacs-5.1.2 试图修改安装位置了，为什么还是在/usr/local/gromacs/share/gromacs/中安装呢？ 2.我应该如何做才能把gmx-5.1.2安装在我home目录下？（或者其他目录下，只要不与4.6冲突，能使用就行） |
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3楼2016-05-14 20:56:13
2楼2016-05-05 12:12:34
cuoce
木虫 (小有名气)
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- 专业: 色谱分析
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你好，我想用cygwin安装gromacs，安装过程如下： 将安装包拷贝到了home/xing里面； tar xvzf cmake-3.6.2.tar.gz cd cmake-3.6.2 ./bootstrap 运行一段时间之后出现如下问题： CMake Error: Could not find CMAKE_ROOT !!! CMake has most likely not been installed correctly. Modules directory not found in /home/xing/cmake-3.6.2 CMake Error: Error executing cmake::LoadCache(). Aborting. --------------------------------------------- Error when bootstrapping CMake: Problem while running initial CMake --------------------------------------------- 请问这个问题该如何解决啊？ |
4楼2017-10-22 21:54:21