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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 动力学的温度设置问题
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yeahhanpei

金虫 (正式写手)

[求助] 动力学的温度设置问题已有2人参与

因为需要做升温然后再降温的模拟过程，所以前面通过建盒子对物质跑了动力学（350K），现在需要测298K时的性质，可以在此基础上，直接298K再动力学模拟么？如果不可以，那又该怎么做呢？？？？
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我的梦想那么大，我却离得那么远！
1楼2016-04-28 15:59:13
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ninitongtong

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
yeahhanpei: 金币+5, ★有帮助 2016-04-29 08:41:06
这个应该是可以的，初始速度你就设置为上次动力学结束所有的速度即可！第二次运行开始的时间段内会逐渐平衡到298K的。再弛豫一段时间后，就可以分析性质了

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4楼2016-04-28 23:50:12
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chuntao118

新虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
yeahhanpei: 金币+5 2016-04-29 08:41:17
我认为是可以的，只需用对粒子的初始速度用298K从新赋值就行了。需要注意的是，在给定新的初始速度后，不能直接的进行相关量统计，必须经过一个弛豫时间是在心的温度下的体系达到热力学平衡。
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2楼2016-04-28 19:27:19
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yeahhanpei

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by chuntao118 at 2016-04-28 19:27:19
我认为是可以的，只需用对粒子的初始速度用298K从新赋值就行了。需要注意的是，在给定新的初始速度后，不能直接的进行相关量统计，必须经过一个弛豫时间是在心的温度下的体系达到热力学平衡。

如何对粒子的初始速度重新赋值

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我的梦想那么大，我却离得那么远！
3楼2016-04-28 22:37:24
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yeahhanpei

金虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by ninitongtong at 2016-04-28 23:50:12
这个应该是可以的，初始速度你就设置为上次动力学结束所有的速度即可！第二次运行开始的时间段内会逐渐平衡到298K的。再弛豫一段时间后，就可以分析性质了

上次动力学结束的所有速度怎么设置啊，我用的forcite模块，动力学里面有个initial velocity的设置，再第二次动力学时，文件选为第一次的最后一帧输出文件，速度选为current。这样可以么？
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我的梦想那么大，我却离得那么远！
5楼2016-04-29 08:44:59
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