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最近做重组PCR,共五个片段,最终把全长扩出后做模板就扩不出了
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前四个片段较小,分别有170;150;110和160,是逐一进行片段重组的,因为片段2和4同源性太高,四个重组完成后进行了TA克隆,测序后证明这四个片段成功重组, 可是,重点来了, 我第五个片段长1894bp,从克隆载体上扩下来的上述片段再与第五个片段重组,Okay,有清晰特异明亮的条带,且长度上相一致, 这个时候还好啊,我就又进行了TA克隆,问题来了,抗性的板子上长出很多菌落,我挑出10个菌落做菌P,只有两个是阳性,用的是我扩增全长的引物,(这个时候是怀疑的,TA克隆不至于这么低吧),再提质粒,酶切显示只是个空载体,求大神指示,哪里出了问题了啊…… 还有一个值得关注的问题,我再以扩出全长(五个片段组装完成)的产物做模板,用最上游和最下游引物,再次进行PCR的时候,没有特异带,完全弥散,急求指点 |
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