24小时热门版块排行榜    

查看: 2642  |  回复: 6
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

mileyfan

新虫 (小有名气)

[求助] LAMMPS仿真水分子出现的不合理现象求助 已有2人参与

大家好
最近尝试用LAMMPS模拟水与一些粒子的反应,在水分子自平衡的过程中会出现单个水分子快速跑离水团的现象,十分困扰!
请问为什么会出现这种情况呢?

我在lammps中用reax力场,加了nvt系综,没有更多fix条件了。
具体如下图

有没有大神可以帮忙解答一下,十分感谢!!!

LAMMPS仿真水分子出现的不合理现象求助
h2o.png
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mileyfan

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by ddll_slsl at 2016-04-13 14:47:55
估计是初始结构不合理。

先把所有原子速度归零, 并用minimize优化,然后再跑MD

尝试了先minimize一下,可是一跑就会出现lost atom,一步也进行不下去啊!请问为什么会出现这种情况呢?

发自小木虫Android客户端
4楼2016-04-17 10:27:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

ddll_slsl

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
估计是初始结构不合理。

先把所有原子速度归零, 并用minimize优化,然后再跑MD
3楼2016-04-13 14:47:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mileyfan

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by ddll_slsl at 2016-04-13 14:47:55
估计是初始结构不合理。

先把所有原子速度归零, 并用minimize优化,然后再跑MD

还有想请问下速度全归0有什么用呢?

发自小木虫Android客户端
5楼2016-04-17 10:29:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ddll_slsl

木虫 (正式写手)

把输出的能量,力,速度等贴出来

发自小木虫Android客户端
6楼2016-04-17 10:32:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 G6APbkg8SA6w 2026-08-29 3/150 2026-08-29 18:59 by 4FFAWE8HcgUD
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+15) +15 晴天加油 2026-08-26 16/800 2026-08-29 18:28 by symmetry
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +5 德尚中行 2026-08-27 6/300 2026-08-29 18:10 by manplx
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 8/400 2026-08-29 17:22 by 4FFAWE8HcgUD
[基金申请] 面上意见出来了 +6 黄鸟于飞Chao 2026-08-29 12/600 2026-08-29 17:20 by 黄鸟于飞Chao
[教师之家] 导师吐槽:我怎么摊上了这么个极品研究生! +9 苏东坡二世 2026-08-23 9/450 2026-08-29 14:41 by hustersqt
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 4/200 2026-08-29 14:02 by jCd0dEvKHShX
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 4/200 2026-08-29 13:51 by jCd0dEvKHShX
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 5/250 2026-08-29 11:49 by jCd0dEvKHShX
[考研] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 6/300 2026-08-29 11:40 by jCd0dEvKHShX
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的? +16 爱看书的可乐 2026-08-26 18/900 2026-08-29 10:18 by winsaint
[基金申请] 我就是申请一个面上项目而已,这评审意见是按照杰青的条件评的吧? +6 gouxfjh 2026-08-28 9/450 2026-08-29 09:59 by jklily
[基金申请] 哪位高人中了,把查询到的截图贴出来让我看看,让我长长见识 +5 yuleib84 2026-08-26 6/300 2026-08-28 00:02 by yudaoqian88
[基金申请] 看板上这么多中的,有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +23 koalala 2026-08-24 26/1300 2026-08-26 14:29 by 宝贝虫子
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 国际合作可查了,中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 今天务委会开完了,明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[基金申请] 某些机构,以效率低为荣,以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑,不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
信息提示
请填处理意见