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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 能量最小化没有跑完
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wahaha28317

铁虫 (初入文坛)

[求助] 能量最小化没有跑完

做了一个体系，22nm的正方体盒子，能量最小化设置了6000步，但是跑了14步就停了，并显示：
Steepest Descents:
   Tolerance (Fmax)   =  1.00000e+01
   Number of steps    =         6000
Step=   14, Dmax= 1.2e-06 nm, Epot=  4.70020e+19 Fmax=         inf, atom= 30818
Stepsize too small, or no change in energy.
Converged to machine precision,
but not to the requested precision Fmax < 10


请问大神这是哪的问题，要怎么解决
求教
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1楼 2016-03-28 16:52:32
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G、sir

木虫 (小有名气)
可以先试试steep，然后再cg，多步最小化，如果还不行就是体系不合理

发自小木虫IOS客户端
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2楼2016-03-30 19:00:07
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wahaha28317

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by G、sir at 2016-03-30 19:00:07
可以先试试steep，然后再cg，多步最小化，如果还不行就是体系不合理

谢谢~我在网上直接下下来的双层膜，什么都没改试着跑了一下能量最小化，也是同样的问题，照您说的方法也还是跑不了，这是体系的问题吗？如果是的话要怎么修改呢？
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3楼2016-04-05 14:56:47
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