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xianglixie3

铜虫 (小有名气)

[求助] primerstar PCR没有条带是为什么呢? 已有3人参与

如题,我用Cdna 扩增表达片段大概2000-3000bp。
Cdna 没有问题,扩增了tub 有带。
我用Taq 酶扩增的时候有带,因为不是高保真的酶所以我想用primerstar 获得片段
试过加了6%DMSO  试过 降低退火温度 本来的退火温度是67 降到了62 还是没有条带
延伸时间用的2-3min
求解!
我都整了一个月了 没有带呀 要死要活的。
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jackyoung

新虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 卡维斯 at 2016-03-18 09:46:30
cDNA扩增长片段是有各种问题的,模板质量得好,浓度合适;选用合适的酶;引物质量合格,高保真酶是应该用高退火的,你可以按照酶的说明书试验一下,扩增效率2000bp/min吧?不用那么长时间。

别坑人,小日本的东西都浮夸,按2k/min是有点儿坑的。我觉得他的原因:
1.瞎折腾,ps酶的buffer有优化,DMSO什么的可以先不用试,直接搞个56-64的梯度试试看,第一步不行先用Taq预括增,没有的话首先怀疑引物,其次是模板;
2.cDNA质量待确认,由于片段较大,反转录的时候一定要用好一点的RT,反转录要保证质量;
3.可以怀疑下引物,至少是认真确认一下你的引物和序列,就有那傻缺把引物设计在启动子或基因下游,没有结果很正常。

发自小木虫Android客户端
CestLaVie
11楼2016-03-19 08:34:47
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卡维斯

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
xianglixie3: 金币+5, ★★★很有帮助, 终于扩出来了 回收之后也超级亮 谢谢 2016-03-19 08:06:38
cDNA扩增长片段是有各种问题的,模板质量得好,浓度合适;选用合适的酶;引物质量合格,高保真酶是应该用高退火的,你可以按照酶的说明书试验一下,扩增效率2000bp/min吧?不用那么长时间。
2楼2016-03-18 09:46:30
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xianglixie3

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 卡维斯 at 2016-03-18 09:46:30
cDNA扩增长片段是有各种问题的,模板质量得好,浓度合适;选用合适的酶;引物质量合格,高保真酶是应该用高退火的,你可以按照酶的说明书试验一下,扩增效率2000bp/min吧?不用那么长时间。

你的意思说 它的退火温度应该比普通酶高是吗
我找找说明书重新看看 然后延伸时间降一些 再做一次
3楼2016-03-18 09:53:24
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卡维斯

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by xianglixie3 at 2016-03-18 09:53:24
你的意思说 它的退火温度应该比普通酶高是吗
我找找说明书重新看看 然后延伸时间降一些 再做一次...

对,仔细研究下说明书按他说的就可以,加油
4楼2016-03-18 09:58:53
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