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shenye.judy

木虫 (正式写手)

[交流] microRNA预测靶基因

最近想做microRNA靶基因的预测,来问问大家一些问题:
1)是不是先把目标物种的mRNA下载下来?比如拟南芥的就去NCBI里把拟南芥的mRNA下载到本地?
2)然后把自己的microRNA序列做成一个文本?
3)再本地化 blast,看看对应的情况?
本人只是这么想的,想请教做过的高手,看看对不对?
4)如果是本地化 blast,是用核酸对核酸的方法吗?需要mRNA正反链都比对吗?
谢谢!
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