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菲顶顶

铜虫 (正式写手)

大家有知道怎么将声子谱里的某一频率和某个原子震动对应起来吗? 据说找到这个原子微调一下有可能会改善,我查看了disp.yaml文件 他给出了移动的是哪些原子,band.yaml文件给出的是不同k点上对应的频率,对于对应频率和原子没有什么帮助,大家有知道从哪里可以查吗
21楼2016-03-11 18:07:00
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dxcharlary

专家顾问 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
菲顶顶: 金币+5, 谢谢您的解答 2016-03-29 15:34:31
非gamma点的虚频意味着你的胞选的太小了。非gamma点的振动模式对应超胞的振动模式。所以你移动单胞的原子没有任何意义。
另外不知道你用什么算法算的,如果你是用的phonopy的话,你要检查你扩胞的OUTCAR,这种大面积的虚频说明超胞本身就是有虚频的。
一般来说,如果你的结构在gamma点附近有一点虚频<1THz,应该是算法问题。其他的基本虚频都意味着结构的动力学不稳定,也就是理论上连亚稳态都不可能存在。至于楼上说的在加热的情况,那个只是准谐近似得到的声子谱在有温度的条件下可能不准确造成的。
22楼2016-03-14 11:41:24
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菲顶顶

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
22楼: Originally posted by dxcharlary at 2016-03-14 11:41:24
非gamma点的虚频意味着你的胞选的太小了。非gamma点的振动模式对应超胞的振动模式。所以你移动单胞的原子没有任何意义。
另外不知道你用什么算法算的,如果你是用的phonopy的话,你要检查你扩胞的OUTCAR,这种大面 ...

谢谢,那请问 这种情况一般怎么解决呢,我用的是phonopy。只能说是他本身就是这样不稳定也不能存在的是吗
23楼2016-03-29 15:30:40
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dxcharlary

专家顾问 (职业作家)

引用回帖:
23楼: Originally posted by 菲顶顶 at 2016-03-29 15:30:40
谢谢,那请问 这种情况一般怎么解决呢,我用的是phonopy。只能说是他本身就是这样不稳定也不能存在的是吗...

phonopy有两种方法,
一种是DFPT,如果使用DFPT的话,一般情况下出现这种大面积的虚频是因为超胞本身就有虚频,所以你要找你计算的OUTCAR文件,看里面的频率部分,找到相应的虚频振动膜,然后加位移优化。
另外一种是位移法,那么你要所有的位移的能量和不加位移的原本结构进行比对,一般情况会有比原始结构能量低的结构,然后把那个结构拿出来进行优化。
24楼2016-03-31 11:35:34
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菲顶顶

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
24楼: Originally posted by dxcharlary at 2016-03-31 11:35:34
phonopy有两种方法,
一种是DFPT,如果使用DFPT的话,一般情况下出现这种大面积的虚频是因为超胞本身就有虚频,所以你要找你计算的OUTCAR文件,看里面的频率部分,找到相应的虚频振动膜,然后加位移优化。
另外一 ...

好的 谢谢您,我查看一下
25楼2016-03-31 21:18:04
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快点跑呀

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
22楼: Originally posted by dxcharlary at 2016-03-14 11:41:24
非gamma点的虚频意味着你的胞选的太小了。非gamma点的振动模式对应超胞的振动模式。所以你移动单胞的原子没有任何意义。
另外不知道你用什么算法算的,如果你是用的phonopy的话,你要检查你扩胞的OUTCAR,这种大面 ...

您好大佬,您说的小于1THz有具体文献参考吗?
26楼2022-01-07 13:21:28
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