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求助分子生物学大神

作者 胡雅彬
来源: 小木虫 450 9 举报帖子
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最近在构建一批质粒,通过双酶切的方式在目的载体上插入400bp左右的PCR产物。之前一直做得好好的。后来发现连接转化后长的克隆慢慢的在变少,由原来的200-300个克隆一点点的变成100个,50个,20个,再后来变成1-2个,现在直接不长克隆了。
     按照分子生物学实验一旦做不出来就全部换新的原则。我拿了新的未开封的限制性内切酶,T4连接酶,换了新买的氨苄和新买的感受态。然而还是没有长克隆。但我拿着之前构建好的质粒做对照,把质粒稀释到0.08ng还能长100-200个克隆。
     接着我把两个限制性内切酶分别单酶切,发现都能切开。单酶切产物切胶回收,用T4连接酶连接后做转化,也能长出100-200个克隆。然而双酶切就是不长克隆。
     做了十年的分子生物学实验,结果遇到了这种不科学的事情。哪位大神知道哪出了问题?@biostar2009@飞约疯人院@wizardfan@youlinglyw 返回小木虫查看更多

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  • 精华评论
  • ULYSSEESWB

    PCR产物双酶切效率低。使用TA克隆双酶切产物连接,或是无缝克隆

  • snoopyzxx

    酶切buffer的问题吧?

  • 来如烟雨

    我也是,请问你现在做出来了吗?

  • 胡雅彬

    引用回帖:
    2楼: Originally posted by ULYSSEESWB at 2021-04-08 16:03:35
    PCR产物双酶切效率低。使用TA克隆双酶切产物连接,或是无缝克隆

    嗯。TA克隆后,换了新买的thermo的限制性内切酶,长了三个,而NEB的还是没长。算是知道个大概问题出哪儿了,只是问题还是没解决

  • ULYSSEESWB

    引用回帖:
    5楼: Originally posted by 胡雅彬 at 2021-04-11 21:06:32
    嗯。TA克隆后,换了新买的thermo的限制性内切酶,长了三个,而NEB的还是没长。算是知道个大概问题出哪儿了,只是问题还是没解决。...

    自从用了无缝克隆,就再也不想着反复酶切连接的事了

  • grm枫

    无缝克隆最方便,可以重新设计引物扩增连接。

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