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有关大肠杆菌CRISPR/Cas9基因敲除

作者 lzk234
来源: 小木虫 400 8 举报帖子
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你们有谁做过大肠杆菌BW25113  Cas9 大片段基因敲除吗,最近在做,筛选到的总是假阳性,检测Cas质粒和TargetF质粒都在,但是就是不敲除,大神们帮忙分析一下原因 返回小木虫查看更多

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  • 精华评论
  • grm枫

    是不是靶点效率不高,换靶点试试

  • fuyuandj86

    大肠杆菌敲除一般不用crispr/cas9, 用重组酶的更多

  • lzk234

    引用回帖:
    2楼: Originally posted by grm枫 at 2021-04-07 04:13:21
    是不是靶点效率不高,换靶点试试

    我怀疑是靶点问题,不过我做了双sgRNA敲除,还是不行,也可能是同源重组酶诱导的不行,导致凡是切割的没有同源重组上,都死了,长出来的都是没有经历过切割的。当然只是猜测,我也觉得靶点效率不高是最有可能的

  • lzk234

    引用回帖:
    3楼: Originally posted by fuyuandj86 at 2021-04-10 12:23:02
    大肠杆菌敲除一般不用crispr/cas9, 用重组酶的更多

    哎,我们老板就是要让我走通CRISPR/Cas9  我也是很无奈啊

  • grm枫

    引用回帖:
    4楼: Originally posted by lzk234 at 2021-04-13 22:16:13
    我怀疑是靶点问题,不过我做了双sgRNA敲除,还是不行,也可能是同源重组酶诱导的不行,导致凡是切割的没有同源重组上,都死了,长出来的都是没有经历过切割的。当然只是猜测,我也觉得靶点效率不高是最有可能的。...

    有验证Cas质粒是正确的吗?

  • lzk234

    引用回帖:
    6楼: Originally posted by grm枫 at 2021-04-14 03:39:36
    有验证Cas质粒是正确的吗?...

    这个我倒是验证过,因为我现在敲除短的片段没有问题(2k以内)长的就不行了。

  • lzk234

    引用回帖:
    6楼: Originally posted by grm枫 at 2021-04-14 03:39:36
    有验证Cas质粒是正确的吗?...

    还有我想问一下,您做过原核单启动子下表达多个基因吗,这些基因要单独表达,而不是串联起来的。

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