质粒电泳会出现几条带
我先前做了pcr片段的克隆，对阳性克隆扩大培养并提取质粒，然后跑电泳，只出现一条带。我的质粒大约5kbp。我看有资料说由于质粒构象的不同可能会出现三条带或更多。提取质粒后电泳到底会出现几条带？我这里出现了一条带正常吗？
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上面是电泳过程中产生的变化。下面查到在质粒提取过程中发生的变化，不知道哪种更可信一些？
用酚、氯仿法从工程菌中提取的质粒一般有三种构像，即超螺旋，线形和开环。（开环质粒是指双链环状的质粒DNA有部分解链，因此电泳速度最慢）三种构像的质粒在琼脂糖电泳的前后顺序是超螺旋>线形>开环，线形的质粒在中间，而开环的质粒在最后。
判断质粒质粒好坏的一个指标就是超螺旋质粒在所以质粒中的含量。因为用质粒转染真核细胞时，超螺旋的质粒效率最高，所以要求质粒中超螺旋质粒的含量要在90％以上，这也是对作为核酸疫苗重组质粒的要求。
根据我做实验的经验，回答你的问题
1 从细菌中大量提取的质粒电泳时，不一定均出现三条带，有时会出现两条，甚至一条(一般是超螺旋的质粒)，这跟上样量也有些关系。出现不同的结果都是由抽提质粒时的操作手法造成的。如果严格按照操作步骤，超螺旋的质粒会较多。
2 酶切将质粒线性化以后，才可以用mark判断大小。如果有三种构像，可以用中间那条带与mark比较判断大小。
3 商品化的质粒我没有直接跑过电泳。我估计应该大部分是超螺旋构像。
4 酶切后线性化条带电泳时所处的位置就指示质粒的大校�
请问楼主用得哪种方法提的质粒？碱法提的质粒三条带中有螺旋，开环另外一条不是线性的DNA，因为在提取中线性DNA已经被降解，这条代为质粒复制时没有分开的两条DNA复合体。
我用的是biomiga的试剂盒提的。今天又提了一次，还是出现一条带。
理论是出来3条带，可是我每次也是只出来一条 。
其实质粒最好的就是呈一条带（超螺旋的那条），3种形态的出现，是因为在提取过程中的外力（一般为机械力）造成的质粒闭合双联环状结构的破坏，从而形成了其它2种的结构形态：线性和缺刻。一般提质粒的时候温柔点，常规电泳都只看到一条亮带
一至三条
三条正常
第一个缺刻，第二个正常带，第三个超螺旋