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分类	共搜索到 19 个相关话题(最多显示前5000个)	作者	最后发表

硕博家园	求助Principal Component Analysis和umbrella sampling学习需要用PrincipalComponentAnalysis和umbrellasampling。在VMD介绍里看到，VMD是可以实现这两个分析方法的。求助广大虫友，给提供点线索，如何着手？如果谁有PCA脚本的话，希望能不吝分享...	baoma57	2017-05-24 09:01
分子模拟	Umbrella Sampling 求大神在做伞形采样的例子，拉伸之后，怎么用VMD将拉伸过程展示出来	qingtian~	2016-09-01 12:10
绿色求助(高悬赏)	Journal of Computational Physics distributionsinMonteCarlofree-energyestimation:Umbrellasamplinginfo'.2.'][info3]JournalofComputationalPhysicsinfo'.3.'][info4]1977info'.4.'][info5]wuinfo'.5.'...	obaica	2016-07-24 09:34
文献求助	文献求助 distributionsinMonteCarlofree-energyestimation:Umbrellasamplinginfo'.2.'][info3]JComputPhysinfo'.3.'][info4]1977,info'.4.'][info5]23:187–199.info'.5.'][info7...	菲同寻常	2016-06-21 01:35
文献求助	Valleau,J.P.Nonphysical Sampling Distributions in Monte ... DistributionsinMonteCarloFree-EnergyEstimation:UmbrellaSamplinginfo'.2.'][info3]J.Comput.Physinfo'.3.'][info4]1977info'.4.'][info5]23,187?199.info'.5.']	hbyi	2016-06-20 01:01
分子模拟	gromacs umbrella sampling problem 有人用gromacs做过umbrellasampling吗？为什么我重复gromacs例子后算的PMF，中间有一段点的PMF特别小？	菲同寻常	2016-03-21 02:42
文献求助	求论文一篇 water:Anapplicationofadaptiveumbrellasamplinginfo'.2.'][info3]J.Chem.Phys.102,419(1995);http://dx.doi.org/10.1063/1.469418info'.3.'][info4]J.Chem.Phys.102,419(1995);...	wjwang123	2015-11-07 01:38
文献求助	求论文一篇 thestatisticalerrorinumbrellasamplingsimulationsbyumbrellaintegrationinfo'.2.'][info3]J.Chem.Phys.124,234106(2006);http://dx.doi.org/10.1063/1.2206775info'.3.']...	wjwang123	2015-11-07 01:54
文献求助	Nonphysical sampling distributions in Monte Carlo free-... distributionsinMonteCarlofree-energyestimation:Umbrellasamplinginfo'.2.'][info3]JournalofComputationalPhysicsinfo'.3.'][info4]1977info'.4.'][info5]Pages187–...	凌云志123	2015-10-26 07:30
博后之家	PhD and Postdoc openings in Nanyang Technological University... variousensembles,withpossiblecombinationswithrareeventmethods(umbrellasamplingand/orforwardfluxsampling)andthermodynamicintegrations.Requirements:Wewanthighly...	adasheep	2015-10-11 08:00
文献求助	Journal of Computational Physics 文献一篇 [info1]MihalyMezeiinfo'.1.'][info2]Adaptiveumbrellasampling:Self-consistentdeterminationofthenon-Boltzmannbiasinfo'.2.'][info3]JournalofComputationalPhysics...	typho0n	2015-10-09 07:29
文献求助	Journal of Computational Physics有全文链接，感谢 distributionsinMonteCarlofree-energyestimation:Umbrellasamplinginfo'.2.'][info3]nullinfo'.3.'][info4]nullinfo'.4.'][info5]nullinfo'.5.'][info6]...	liupeng555	2015-05-06 01:21
文献求助	求一篇Physical Chemistry Chemical Physics bysteeredmoleculardynamicsandumbrellasamplingsimulationsinfo'.2.'][info3]Phys.Chem.Chem.Phys.info'.3.'][info4]2015info'.4.'][info5]inpressinfo'.5.'][info7]...	ferlich	2015-04-28 12:11
分子模拟	umbrella sampling 我想用GROMACS利用umbrellasampling计算A，B两个物质在水中的自由能，但苦于总是理解不了这个过程，而且做了umbrellasampling教程，但在运行完distances.pl这个脚本之后得出的summary.dat和...	zhuxinzhe	2015-01-05 07:18
文献求助完结子版	A NMR and metadynamics-umbrella sampling inv	匿名	2014-10-08 08:16
分子模拟	gromacs tutorial 教程Umbrella Sampling算PMF，g_wham不能输出... 在tpr-files.dat放进了指定的文件名umbrella0.tprumbrella1.tpr.在pullf-files.dat也放了pullx-umbrella0.xvg.用命令g_wham-ittpr-files.dat-ifpullf-files.dat-o-hist-unitkCal输出的文件...	a4561799	2014-09-17 01:07
分子模拟	【求助】NAMD怎么做umbrella sampling 看user'sguide中只说了可以做，具体怎么做找不到什么说明，大家有做过的吗，请求帮助？	shabeir	2010-12-31 07:51
第一性原理	【求助】MD umbrella sampling 大家好，我想问下MS中用umbrellasamplingmethod计算自由能改变是在哪个模块中，哪里能找到？还有orderparameter（OP）在哪？以上都是文献中看到的，希望大家帮帮忙，谢谢了。	mountwar	2010-12-03 11:14