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分类	共搜索到 109 个相关话题(最多显示前5000个)	作者	最后发表

分子模拟	升高温度RDF图第一峰峰位为什么不移动甚至左移？在做金属在不同温度下的径向分布函数图，做出的结果如下图。随温度升高第一峰峰位保持不变甚至左移，这是为什么呢？温度升高晶格热膨胀，原子在格点附近运动，原子间距离增大，第一峰位不...	火锅猎人	2022-06-12 03:54
分子模拟	晶体形貌预测和RDF图如表1晶体形貌分析，其中静电力是为0，请问什么原因呢。如图2对DNP的o和cl-20的H做径向分布函数图，感觉不对，请问这是什么原因呢	詹俸碧z	2022-05-21 11:34
分子模拟	ovito 配位数、RDF和ADF 前辈们、朋友们，你们好！最近我在尝试使用MD模拟单晶SiC的纳米切削实验。我想问一下，在利用配位数...3、如何显示出单一晶相的RDF呢?下图是我自己操作所得的配位数分布图江湖救急，先行感谢！	HJieY	2021-07-16 09:00
分子模拟	杂谈自由能计算，PMF，伞形抽样，WHAM 放开这俩分子让它们在水里跑，最后计算它们之间的径向分布函数g(r)，又叫RDF,而RDF恰好就是两分子相距不同距离的概率密度。...WHAM,WeightedHistogramAnalysisMethod,加权柱状图分析法，...	可爱草莓	2021-07-16 09:28
分子模拟	分子模拟请问，在做晶体生长方向时，考虑溶剂效应，建立了一个溶剂模型，怎么做RDF图	蓝烟袅袅	2021-06-09 02:41
分子模拟	高分子纳米颗粒的自组装模拟最近，想做高分子材料的自组装模拟，主要是做粗粒化模拟，探索其自组装机制，需要三维立方图，RDF函数，密度场能量变化等数据。后续考虑做纳米颗粒进入细胞或者组织的模拟，这个比较难，找...	三两尤加利	2021-04-29 02:13
导师招生	英国诺桑比亚大学锂离子电池、微流体方向招收全奖博士2名项目详情:'https://www.findaphd.com/phds/project/controlling-directional-spreading-on-smart-surfaces-advert-reference-rdf21-ee-mpee-brinkmannmartin/?p127496'?申请截止日期:...	jasonbrownwu	2021-01-09 02:44
分子模拟	如何得到晶态的氧化锆，求助 in文件参考了例子中Cu的熔化凝固脚本，熔化过程的测试脚本及总能量-温度曲线分别见图1和图2，有两个转变点分别在3060K和3660K...升温-in.png升温-曲线.png降温-in.png降温-rdf.png降温-曲线....	macan2945	2020-10-24 05:41
分子模拟	vasp计算分子动力学，使用VMD做非晶的径向分布函数（rdf），但是... 下面是我用VMD作的图，到了那个距离直接就下降为0，不知道其中的原因。网上查是说可能是截断半径太小了，但是VMD哪里可以设置截断半径嘞？初学VMD,多谢各位的指导了。QQ截图20200607160439....	suncoffee	2020-06-07 08:53
计算模拟	MS 分子模拟中 RDF径向分布函数求助各位老师好！我已经对体系进行了优化并设立了setC和O我想要分析C-O的RDF用Forcite但图是一条接近零的线和文献中差太多这是为什么	JORYA0208	2020-06-06 08:15
分子模拟	lammps模型案例干货基础入门内容线上不停学包括能量最小化-NVT平?，对研究目标的性质进行长时间轨迹平?-输出研究所关心的性质8.6采用VMD查看动态轨迹8.7数据分析，计算RDF，MSD，密度分布，选择性等?实例操作：包括在VMD中查看...	dhyfgj111	2020-04-15 05:52
分子模拟	MS分子动力学模拟后查看RDF曲线峰杂乱的问题在查看分子内具体原子距离金属表面的距离，用forciteRDF，选定该原子为seta,金属表面第一层所有原子为setb，出来的径向分布函数曲线很乱，没有明显峰值点，如图，请问是怎么回事？...	番茄龙利鱼	2020-04-05 01:51
分子模拟	MS软件RDF分析求解采用MS对沥青进行建模分析，采用的是沥青四组分十二分子，按照文献的方法进行对应的NVT,NPT处理，最后对四组分进行RDF分析，建立完set之后选择的rdf图像跟文献中的相差太大，但是还不知道...	傲傲的	2020-03-31 03:04
分子模拟	Material studio(MS）软件介绍及其应用的领域图2Forcite模块建立的分子动力学模型图3三种腐蚀介质粒子在缓...（3）对体系进行分子动力学模拟，体系平?后，对体系中的物质进行RDF（径向分布函数）分析，MSD（均方根位移）分析，键长、键角...	hazheng	2020-01-27 10:46
分子模拟	分子模拟，第一性原理，菜鸟需要求助了分子动力学模拟、第一性原理计算能在很大程度上进行预测指导实验，在各领域的研究中发挥越来越重要的作用，相关的...数据分析（origin软件的使用）7.6.1MSD分析7.6.2计算RDF7.6.3计算密度分布	jin_jing	2019-10-25 10:31
石油化工	有在用分子动力学lammps的吗？分子动力学模拟、第一性原理计算能在很大程度上进行预测指导实验，在各领域的研究中发挥越来越重要的作用，相关的...数据分析（origin软件的使用）7.6.1MSD分析7.6.2计算RDF7.6.3计算密度分布	互动派赵	2019-10-15 09:45
分子模拟	ms8.0关于forcite几何优化和指定特定分子当我把晶体表面所有原子固定后，再进行几何优化总是存在问题，几何优化过程中的能量曲线会出现跳跃，如下图，还没到指定的5000次迭代就会停止...跑动力学的话如何将这一大类统一分析RDF或者...	心慌方	2019-08-23 05:44
分子模拟	forcite计算rdf求助。得到了图中的结果，发现两个分子，有total，inter，intra三条曲线。inter曲线几乎是0。想知道这个意思是两个分子间没有π—π作用力?还是应该看intra。不太清楚两个分子的intra和inter是啥...	18018590138	2019-06-14 05:15
分子模拟	MD分子动力学模拟-径向分布函数的问题作者在文章中用到径向分布函数(RDF)，通过模拟甲醇-甲醇、甲醇-水和水-水的O…H之间的距离来证明他们之间形成氢键，且甲醇-水...附图：以下是我模拟的图和文献的图我模拟的图.jpg文献的图.PNG	momentu335	2019-06-09 01:51
分子模拟	通过RDF函数来判断粒子间作用看到文献用RDF来判断粒子间作用的大小，有几个问题请教：1.在分析RDF时是否需要勾选includeintra/intermolecularcomponents2....即下图的RDF表示的是不是最高峰对应的r呢？文献图表	943886740	2019-05-05 03:19
分子模拟	MS中计算RDF失败求大神指教一下这是为什么呢？本人是新手，一直提示Needatleastoneparticleorcentroidineachset.qq图片20190429200520.png	kiss落樱	2019-04-29 12:23
分子模拟	LAMMPS-gromacs课程查看动态轨迹和特殊帧的图片显示(采用VMD软件做出漂亮的图片和视频，学会用tcl脚本控制输出)6.7数据分析（origin软件的使用）6.7.1MSD分析6.7.2计算RDF6.7.3计算密度分布实例操作：包括在...	Wanghahax	2019-04-28 03:52
分子模拟	lammps内容请看查看动态轨迹和特殊帧的图片显示(采用VMD软件做出漂亮的图片和视频，学会用tcl脚本控制输出)6.7数据分析（origin软件的使用）6.7.1MSD分析6.7.2计算RDF6.7.3计算密度分布实例操作：包括在...	旧梦如烟	2019-04-28 02:01
第一性原理	关于VMD处理vasp计算输出的vasprun.xml得到的径向分布函数RDF，... 下面的图是我用VMD处理得到的一个结果，万分感谢您的帮助捕获.PNG捕获1.PNG捕获2.PNG	天迹浪涯	2019-03-21 01:42
分子模拟	rdf图 rdf图有人可以给解释一下吗	莹莹的狗	2018-11-14 07:39