帖子
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 站内搜索
9081/37123456下一页
显示全部
分类 共搜索到 908 个相关话题(最多显示前5000个) 作者 最后发表
考博 25届申博-求博导
研究生期间做过多个横向课题，专业知识扎实，熟练使用Schrodinger，sybyl，gromacs等软件，会基本的Ubuntu系统操作。研究生期间以第一作者发表sci论文一篇，另有一篇sci论文在投，专利一篇...
 冰峰 2025-02-23 01:16
分子模拟 sybyl画图无法导出
为啥我画完图无法导出啊？smutaooxox6085
 hhhe. 2024-11-28 04:49
量子化学 sybyl-x 2小分子构象搜索教程
不知道有没有大佬用过sybyl-x2.0用MMFF94s做过小分子构象搜索的教程，网上查了很多都是关于做分子对接的，希望好心人细心讲解一下，非常感谢！
 ZEUSCJP 2024-10-15 03:09
分子模拟 想求一位做SYBYL-X大佬有偿答疑
本人做分子动力学遇到了点问题卡着无法前进，想求一位会分子模拟的大佬答疑
 考研调剂彭媛 2024-09-27 01:39
考博 2025申博求助-CADD分子模拟和药物设计方向-求老师收留
vina,qvina,smina,ledock都有过使用和分析经验Sybyl-SulflexdockGromacs与Namd做MD，mmpbsa/gbsa计算（Gromacs）Rdkit计算小分子的药化性质和分子指纹2D计算和分子转换（Openbabel也用）...
 yixiaoyu1994 2024-08-17 05:36
分子模拟 使用sybyl GALAHAD建立药效团 能量值太大怎么办？
选取的已知化合物最好的一组能量值在100以内，但specific一直达不到5.其他组的specific在3-6之间都有，但能量在十几万百万左右.请问如何是能量值降低？参数population和Maxgeneration如何...
 盐汽水1121 2024-07-05 07:03
分子模拟 sybyl对接结果不显示CScore结果是为什么呢？
想问下最近用sybyl对接为什么都不显示cscore的打分结果，每次对接完系统都显示INFORMATION:FoundCScoredata.processing.Emptyfile.Ambiguousorunrecognizedcommand"EMPTY"，这是为什么呢，...
 athenadai219 2023-11-10 12:58
计算模拟 请教电负性预测的方法
请教大家一个问题：一个小分子预测他的电负性，在sybyl-x2.1.1中怎么实现的。文献中报道可以实现，但是没有具体的步骤，知道的希望分享一下，非常感谢。
 2010missB 2023-11-03 01:31
新药研发 Sybyl-x2.1.1跑FUGUE找不到allprf
Errorreportedbyfugueseq.c:Filenotfound(cannotopenfilecontainingthelistofprofiles:/SYBYL/sybylx2.1.1/./orchestrar_db_1009/homstrad/allprf.lst)allprf.lst文件会自动生成在我选择...
 雷555雪 2023-09-22 05:09
计算模拟 SYBYL做3D-QSAR分析求助！
在SYBYL做3D-QSAR，将分子导入表单之后，做能量最小化时，软件操作界面直接卡死，能量计算值全为0，这是为什么呀，求各位大佬告知或者遇到过同样问题的伙伴们可以告知解决办法吗所用软件...
 HF161416 2023-05-13 02:00
分子生物 计算机辅助药物设计(CADD)如何入手,速看(包含gromacs).
基于片段的bcr/abl靶点抑制剂优化与改造第五天下午构效关系分析1.3d-qsar模型构建（sybyl软件）1.1小分子构建1.2创建小分子数据库1.3小分子加电荷及能量优化1.4分子活性构象确定及叠合1.5...
 科研小生k 2023-04-27 02:19
新药研发 求助sybyl-x-2.1.1的Windows 11免费安装包，谢谢！
求助sybyl-x-2.1.1的Windows11免费安装包，谢谢！
 HangSUN 2023-04-13 08:44
考研 华南理工105500药学323分求调剂
政治58英语二67药学综合198总分323毕业于武汉工程大学制药工程专业，...对计算机辅助药物设计有实践基础，熟练运用autoCad和Sybyl2.2.1。联系方式电话/微信：13476914529邮箱：710930406qq.com
 陈浩然666 2023-03-12 01:01
计算模拟 Sybyl对接无法导出图片
请问用sybyl做含有Au的分子对接，可以正常打分，导出图片时无法产生活性位点表面该怎么解决呢
 素白20485 2022-12-06 03:24
计算模拟 SYBYL X做HQSAR如何制作分子表单
看sybyl的HQSAR教程时，有一个文件名为diazepam42的分子表单，这个分子表单中需要导入什么数据才能进行HQSAR建模呢？
 harriet7929 2022-11-08 03:18
博后之家 SYBYL 2.0做CoMFA导出立体场时，如何能将显示区域调成透视看见...
SYBYL2.0做CoMFA导出立体场或者静电场时，如何能将红色或者绿色显示区域调成透视看见遮挡的骨架，求大神帮忙解答
 时锦超 2022-09-08 01:41
考研 求调剂农学类 畜牧兽医水产 分数297
2.担任药理学实验室助理，帮助老师管理实验室协助老师工作，论文研究为网络药理学方向，生信分析，会操作cytoscape制图，sybyl分子对接等相关软件。3.大学期间有实习经历，协助医生在动物的...
 xyd0924 2022-04-01 05:24
仿真模拟 各位专家老师好，我想请问一下cif格式的受体（没有pdb格式.
各位专家老师好，我想请问一下cif格式的受体（没有pdb格式的下载）可以用sybyl做分子对接吗？可以的话怎么做呢？手上的教程似乎没有这方面的，都是用pdb格式的。可以的话怎么做呢？wuming...
 xiaoqi745 2022-03-07 11:56
药学 拿到一个药物相关课题后应该开展哪些工作及如何开展？
实例讲解与练习：ZDOCK模拟2019-nCoV的spike蛋白6VXX和ACE2蛋白晶体结构的相互作用构效关系分析1.3D-QSAR模型构建（Sybyl软件）1.1小分子构建1.2创建小分子数据库1.3小分子加电荷及能量优化...
 pang04 2022-03-04 02:21
新药研发 {CADD}基于碎片的药物设计与发现
实例讲解与练习：ZDOCK模拟2019-nCoV的spike蛋白6VXX和ACE2蛋白晶体结构的相互作用构效关系分析1.3D-QSAR模型构建（Sybyl软件）1.1小分子构建1.2创建小分子数据库1.3小分子加电荷及能量优化...
 pang04 2022-02-24 08:28
分子模拟 Amber、Gromacs学习心得
分子对接研究，Pymol软件的使用，ACE2，蛋白小分子相互作用图解，同源蛋白，蛋白模型优化，构建大环，天然产物，Autodock使用，蛋白受体格点计算，1IEP晶体复合物，ZDOCK的使用，Sybyl软件...
 pang04 2022-02-22 08:10
新药研发 CADD生物药物分子相互作用、虚拟筛选
实例讲解与练习：ZDOCK模拟2019-nCoV的spike蛋白6VXX和ACE2蛋白晶体结构的相互作用构效关系分析1.3D-QSAR模型构建（Sybyl软件）1.1小分子构建1.2创建小分子数据库1.3小分子加电荷及能量优化...
 pang04 2022-02-14 07:42
计算模拟 sybyl-分子对接-surface name 怎么处理
虫友们，我在用sybyl做一个酶与配体的对接，在优化蛋白结构的时候，出现了如图所示的问题(option-surfacename;但是没有任何文件可供选择)，请问怎么处理？谢谢问题-surfacename.png
 wizard530 2021-12-26 11:39
9081/37123456下一页