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晚上和朋友去了一趟上海浦东的佛罗伦萨小镇，发现这……'https://m.toutiao.com/is/MC-M0r3NPt8/'-

问题1:构建ac盒子时，密度应设低（0.6），还是正常（1）问题二:AC盒子建后，是否进行结构优化，和（nvt，npt）动力学，然后再运行交联脚本问题三:我仅仅只跑了10轮退火，50ps两种动力学，...

我做了蛋白7nfb和槲皮素的分子动力学模拟，nvt、npt都平?了200ps，最后运行了50ns，中途电脑断了一次电，我后面用命令接着跑，但后面跑出来的图总是存在问题，（由于图片上传不上来，我用...

随后模拟先采用NVT弛豫300ps，随后NPT模拟700ps。文献中提到（J.Chem.Phys.125,034503(2006)）TIP4P/2005模型的水分子临界参数（640K，14.6MPa）和实际水分子（647.1K，22.06MPa）的有差异...

我的想法是，采用reaxff力场，先采用nvt与npt结合的方法对系统进行弛豫，然后再使用npt进行升温模拟请问这种想法是否可行、是否能模拟出它这个相变过程，如有问题请各位老师指出，此外通过...

SOL,KSTEP,KINC,TIME,NOEL,NPT,COORDS,JLTYP,1TEMP,PRESS,SNAME)CINCLUDE'ABA_PARAM.INC'parameter(one=1.d0)DIMENSIONCOORDS(3),FLUX(2),TIME(2)CHARACTER*80SNAMECQ,激光有效热功率WCv,...

麻烦请问一下，我想建立一个密度是1的溶液盒子，建立好之后我进行了forcite的nvt分子动力学，再进行npt退火之后发现密度降低很多只有0.6多。我是什么步骤出问题了么。谢谢回答。smutao

DorothyDasORCIDIcon,PriyamBharadwazORCIDIcon&VenkataSatishKumarMattaparthiComputationalinvestigationontheeffectofthepeptidomimeticinhibitors(NPT100-18AandNPT200-11)ontheα-...

用vasp跑AIMD，用的是npt系综，建立的是3x3x1200个原子左右的超胞，想算不同温度下的极化值，从而估算它的居里温度，但做出的图杂乱无章，为什么会这样？

另一种做法，是进行npt系综模拟，沿z轴向上使用external_pressure标签，添加外力（如external_pressure=0.00.01.0），并使用pstress标签设施压力为0。请问这两种做法，哪种合理呢？能麻烦...

但是就初步来说，在nvt系综下弛豫一段时间后，然后用npt系综进行加热压缩，模型密度不是预想中的慢慢增大，而是迅速下降。按道理来说，我的沥青模型密度会逐渐增大并且趋于稳定，随后我在此...

张峻豪矩形磁控溅射的磁场模拟分析及优化东北大学20132013年第4期...uniplatform=NZKPT&language=CHS中国知网CNKI

DorothyDas1,PriyamBharadwaz2,VenkataSatishKumarMattaparthi1Computationalinvestigationontheeffectofthepeptidomimeticinhibitors(NPT100-18AandNPT200-11)ontheα-...

各位老师，做水合物拉伸时候屈服强度大了10倍，单位是GPa，数值是6-8左右，这是怎么回事那？...timestep0#npt弛豫fix1allnpttemp270270100x98.6998.691000y98.6998.691000z001000thermo_...

求大佬指点，请问怎样在lammps中使用NPT系综下求模拟总体全部分子的平?体系？我看文献中求密度使用公式中均需要此项VE，而lammps的thermal中density输出在确定盒子以及分子下无论温度怎么...

我是模拟的纳米带的导热，先最小化，然后对整体npt控温控压，接着固定两侧边界，然后对hotcold中间的传热区用nve，hot和cold区域设置为nose热浴，用的nvt，结果这个热浴一加上，温度就乱跳...

Vani,VV(Vani,VemulaVijaya)[1]Studyon3Dprintedauxeticstructure-basednon-pneumatictyres(NPT\'S)materialsandmanufacturingprocess20221280-1297DOI10.1080/10426914.2022.2039692...

在做有机质裂缝壁面吸附的时候,用NPT进行第一步优化会导致体系的模拟盒子变化从而导致要求的狭缝宽度变化,如何控制缝宽,又能够使用NPT进行优化呢?想问下各位控制缝宽的方法

小弟我用VASP进行aimd计算，NPT系综，设定600K，始终无法达到设定测试，相差200K左右。恳求各位大牛指点一二，跪谢！以下为INCAR文件：#GlobalParameters#SYSTEM=aimdISTART=0#...

oISIF：在分子动力学计算中，此标签用于选择NVT系综或NpT系综（NVE系综是一个特例！对于ISIF=2，体积保持不变并使用NVT系综。使用此标签可以计算应力张量，因此可以监控压力。对于ISIF=3，...

分子动力学简介（gromacs软件）1.1分子动力学基本原理1.2linux系统介绍1.3分子动力学软件介绍（gromacs）2.gromacs进行分子动力学模拟2.1配体分子的处理2.2蛋白结构的处理2.3修改蛋白坐标...

求下载一个百度文库文档，谢谢啦！'...

有哪位大佬知道用MS软件如跟图片似的，使...我建完溶液盒子后跑NPT系综，发现分子仍然填满盒子，有哪位大佬知道该怎么设置吗？'https://pan.baidu.com/s/1glcNRUGMHr-RgCdYP2DgoA'提取码5q45

请教一个问题，我用lammps模拟的时候，往一个盒子里插入了单条polymer链之后对体系进行平?，模拟运行到一半会...（平?过程用的npt，周期性边界条件，polymer链内部的原子间用的fene力场）