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1楼2015-12-28 12:58:25

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lamda

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小炒肉: 金币+15, ★★★★★最佳答案 2016-03-17 21:00:18

试着计算了一下楼主描述的分子，进行了如下操作：
1. 在B3LYP/6-31+G*水平上对分子进行了优化；
2. 在B3LYP/6-311++G(2d,p)水平上，用IEFPCM模型模拟DMSO溶剂环境，对分子进行了NMR计算。
结果如下
环上H: 6.37（6.03）甲基：2.23（2.15）氨基：4.62 （6.71）
讨论：
环上和甲基氢的计算值与实验室相差<0.34，但氨基误差为2.09。前二者为非极性氢，后者就极性氢。
DMSO为极性溶剂，其-SO-基团对极性氢的NMR化学位移会有很大的影响。预计加入两个显性的DMSO分子，进行结构优化后将会显著改善计算结果。
结论：
对比楼主的计算结果，可以说明一下两个问题。
1. 结构优化非常重要，无论分子大小与否；
2. 高级别的计算对提高计算的准确度有帮助；
3. 对于溶质包含极性氢原子和溶剂包含极性原子的溶液体系，考虑显性溶剂分子很重要。
计算附图如下
http://pan.baidu.com/s/1bpSAcu

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9楼2015-12-29 10:27:09

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jiewei

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1：方法；（没贴）
2：结构；一般来说这么简单的结构不会出现优化的问题。所以为第一种

我想做个科学家，可我又喜欢写诗；我想做一个诗人，可我却读的理工科..

2楼2015-12-28 14:10:29

小炒肉

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2楼: Originally posted by jiewei at 2015-12-28 14:10:29
1：方法；（没贴）
2：结构；一般来说这么简单的结构不会出现优化的问题。所以为第一种

就设置了这些，不知道哪出问题了……

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3楼2015-12-28 14:38:35

Jasminer

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核磁计算对构象、基组、显式溶剂分子都很敏感。

4楼2015-12-28 17:25:14

jimsmart

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可能是计算有些误差, 调整一下参数试试?

5楼2015-12-28 19:34:10

小炒肉

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5楼: Originally posted by jimsmart at 2015-12-28 19:34:10
可能是计算有些误差, 调整一下参数试试?

我试了一下，单算一个噻唑，没问题，只要2号位氨基加上去，算得结果就不对了……

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6楼2015-12-28 19:42:33

小炒肉

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5楼: Originally posted by jimsmart at 2015-12-28 19:34:10
可能是计算有些误差, 调整一下参数试试?

4号位有个甲基，核磁图也是对的，估计是那个氨基的影响，可是我不知道怎么设置才对……你知道不？

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7楼2015-12-28 19:57:08

virtualzx

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你的基组很小；NMR需要较大基组才能准确，最低也要6-311G+(d,p)才有点靠谱，（当然最好更大点，这样小的分子CBS都没问题），而且还需要添加核极化基组(比如CQZP基组，实在没办法也可以用mixed来自动添加核极化）

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8楼2015-12-29 02:42:11

lamda

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上贴中括弧内的数值为实验值。

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10楼2015-12-29 10:32:39