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【调剂】北京石油化工学院2024年16个专业接受调剂
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鱼yao

铜虫 (小有名气)

[交流] SSR引物多态性已有9人参与

虫友们好，有个问题想请教一下大家，我现在有50个SSR引物，准本用三十个个体去检测它们的多态性，现在的师兄提供了一个方法，跑聚丙烯酰胺去检测它们的多态性，请问还有更好的方法吗？在线等，不胜感激。
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人都一样
1楼2015-11-07 10:39:46
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鱼yao

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by ufo29119690 at 2015-11-07 13:01:26
送出去做基因分型

50个引物，30个个体，1500个样，10元一个样，需要1.5万，有点贵了，请问跑聚丙烯大概需要花费多少？
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人都一样
5楼2015-11-07 16:19:48
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杜仲谷

木虫 (职业作家)

金虫
★
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我做了100对引物了，聚丙烯酰胺凝胶电泳所需试剂才花了500块钱，如果算上购买电泳槽嘚话1700元。
我的DNA样本是90个，属于3个不同的物种，拿15个样本初筛多态性引物。8%非变性PAGE检测结果，0.1%银染，NaOH溶液显影。
SSR引物多态性



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从事分生的药学生
6楼2015-11-07 16:51:41
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穆远life

木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
你如果东西凑齐，一个人四天就能完成的事情。

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10楼2015-11-08 14:59:21
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鱼yao

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
17楼: Originally posted by ufo29119690 at 2015-11-08 16:30:58
还想请教一下  等位基因数目要在多少个以上  才能判定这个位点具有多态性呢
...

多态性不是通过这个判断的，是根据同一个引物在三十个个体（最少三十个个体）跑出来的条带不同，就说明这个引物具有多样性，如果三十个个体的条带是一样的，在同一水平线上，那么这个引物就不具有多态性。等位基因数是判断纯合杂合的
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人都一样
27楼2015-11-08 20:28:19
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ufo29119690

金虫 (小有名气)
★
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引用回帖:
44楼: Originally posted by 杜仲谷 at 2015-11-08 23:44:48
退火温度我也筛选过。...

我有个猜测 因为ssr都是连续的重复序列  在复制的时候有概率出错 才在不同样本上出现长度差异  会不会是pcr时 也会出现这种情况才导致出现了 多条带呢

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47楼2015-11-09 00:01:37
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普通回帖

鱼yao

铜虫 (小有名气)
谢谢
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人都一样
2楼2015-11-07 10:41:39
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骑着王八看海

新虫 (初入文坛)
毛细管电泳
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3楼2015-11-07 12:43:40
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ufo29119690

金虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
送出去做基因分型

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4楼2015-11-07 13:01:26
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ufo29119690

金虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
5楼: Originally posted by 鱼yao at 2015-11-07 16:19:48
50个引物，30个个体，1500个样，10元一个样，需要1.5万，有点贵了，请问跑聚丙烯大概需要花费多少？...

确切是多少我也不知道 但是要比送出去便宜很多

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7楼2015-11-07 23:04:05
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鱼yao

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by ufo29119690 at 2015-11-07 23:04:05
确切是多少我也不知道 但是要比送出去便宜很多
...

嗯，谢谢了，准备跑电泳了
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人都一样
8楼2015-11-08 14:19:23
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鱼yao

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 杜仲谷 at 2015-11-07 16:51:41
我做了100对引物了，聚丙烯酰胺凝胶电泳所需试剂才花了500块钱，如果算上购买电泳槽嘚话1700元。
我的DNA样本是90个，属于3个不同的物种，拿15个样本初筛多态性引物。8%非变性PAGE检测结果，0.1%银染，NaOH溶液显影 ...

非常感谢，我的做的内容和你的基本是相同的，非常感谢你，请问电泳槽在哪个公司买的？多少钱一个？
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人都一样
9楼2015-11-08 14:31:27
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