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【调剂】北京石油化工学院2024年16个专业接受调剂
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wangliually

新虫 (初入文坛)

[求助] NUPACK nucleic acid package的使用方法已有1人参与

有没有人用过 NUPACK nucleic acid package啊？求详细的使用手册。不是官网上下载的nupack_user_guide_3.0这样的文件。是要详细介绍怎样设计序列，分析序列存在的各种可能性的及比例，编写代码等等的详细介绍。
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1楼2015-07-21 19:46:24
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wangliually

新虫 (初入文坛)
自己帮顶先
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2楼2015-07-22 14:55:42
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asy10001

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by wangliually at 2015-07-22 14:55:42
自己帮顶先

如果不是要求计算很细节的东西的话，NUPACK官网http://nupackweb.piercelab.caltech.edu/design/new 应用界面的Demos和Help就足够用了。如果楼主需要计算更加细节的东西的话，建议学习Vienna RNA Package里边的程序或者应用界面，  http://rna.tbi.univie.ac.at/，我也不是很懂，一点点建议~
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我只想安静的做一只实验狗
3楼2015-10-31 13:18:51
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MY-Donghai

新虫 (初入文坛)
duplex region displayed
a ΔG <= -18 kcal/mole (calculated using the software NUPACK
with parameters corresponding to 60℃ and a  salt concentration


楼主知道这个怎么操作吗？请指导一下
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4楼2016-05-27 20:29:50
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darling大玲

银虫 (小有名气)
请问楼主问题现在解决了麽，生物小白一枚，现在在序列设计上卡住，求助求助

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5楼2018-03-16 12:19:16
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我不吃了

新虫 (初入文坛)
请问师兄/师姐找到方法了吗？我到这里给卡住了，不会用nupack

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6楼2019-09-17 16:02:10
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我不吃了

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by darling大玲 at 2018-03-16 12:19:16
请问楼主问题现在解决了麽，生物小白一枚，现在在序列设计上卡住，求助求助

我也是在这里卡住了！师兄/师姐有没有找到解决的方法啊！开课题真的好难

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7楼2019-09-17 16:04:54
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ine

木虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by MY-Donghai at 2016-05-27 20:29:50
duplex region displayed
a ΔG &lt;= -18 kcal/mole (calculated using the software NUPACK
with parameters corresponding to 60℃ and a  salt concentration


楼主知道这个怎么操作吗？请指导一下

请问您这个文献标题是什么？谢谢
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幸福原本不多，珍惜累积渐长。
8楼2022-09-19 18:59:00
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YU1012058164

新虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by wangliually at 2015-07-22 14:55:42
自己帮顶先

楼主，有吗？
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我的论坛我做主
9楼2022-11-30 22:34:33
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