【调剂】北京石油化工学院2024年16个专业接受调剂
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lyq8976

铜虫 (初入文坛)

[求助] 求助,序列提交genbank问题已有1人参与

本人分子生物学一点也不懂,从生工拿到序列后提交ncbi,收到genbank这样一封邮件 ,很是忧伤,求大神解答帮助希望不要重做
We have received the following 6 sequence submission(s) from you:

Seq1.sqn :  (6)

BLAST similarity search analysis indicates that one or more of your
sequences contain little or no similarity to ribosomal RNA sequences
in the database:

no match over partial sequence (not a full-length match):
Seq4
Seq3
Seq1
Seq5
Seq6


Ribosomal RNAs are generally highly conserved and thus, we would
expect to see similarity to other rRNA sequences over the entire
length. A lack of similarity over the entire length of the sequence
may be due to one of the following:

- low quality sequencing (usually occurs at the ends and may
     simply require trimming of the submitted sequences)
- chimera formation
- misassembly of the sequence reads
- vector contamination
- PCR artifact

If the sequences are correct, please provide a detailed reply
explaining these results.

If the sequences are not correct, resubmit the complete file or
set not just the revised sequences.

Send your reply to: gb-admin@ncbi.nlm.nih.gov and your resubmitted
sequence(s) through either BankIt or Sequin. Please be sure to
indicate it is a "resubmission of grp xxxxxxx".  

If we do not hear from you by Jan 30, 2015, all of your submission(s) will
be deleted from the processing queue.

Thank you for your attention.  We will not assign GenBank Accession
Numbers or further process your submissions until we hear from you.

For your reference, please find your preliminary records below.

Please reply using the original subject line.
This will allow for faster processing of your correspondence.
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lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
感谢参与,应助指数 +1
lyq8976: 金币+100, ★★★很有帮助, 谢谢非常感谢 2015-06-14 10:44:44
你提交的Seq1、3、4、5、6不是RNA序列,他们通过比对这几个序列与RNA序列同源性很低,根据RNA序列保守的特点判断出这几个序列不是RNA序列,因此要你确定。
2楼2015-06-13 08:46:17
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lyq8976

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lxj341401 at 2015-06-13 08:46:17
你提交的Seq1、3、4、5、6不是RNA序列,他们通过比对这几个序列与RNA序列同源性很低,根据RNA序列保守的特点判断出这几个序列不是RNA序列,因此要你确定。

噢噢噢噢是不是改一下就行了?
虽然你不曾拥有一场说走就走的旅行,但至少还有一个说胖就胖的体型
3楼2015-06-14 10:44:21
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lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by lyq8976 at 2015-06-14 10:44:21
噢噢噢噢是不是改一下就行了?...

你自己做个BLAST分析确定下你提交的序列1、3、4、5、6,然后根据结果改下。
4楼2015-06-14 11:00:09
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lyq8976

铜虫 (初入文坛)

是不是要把gap删掉?gap比较多,能不能把序列给你帮我看下?

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
虽然你不曾拥有一场说走就走的旅行,但至少还有一个说胖就胖的体型
5楼2015-06-15 18:21:34
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David_wyq

金虫 (小有名气)

现在问题解决了么?相同的问题,求分享经验
读万卷书不如行万里路,行万里路不如阅人无数,阅人无数不如名师指路。
6楼2015-07-28 15:03:33
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renyuan521

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by lxj341401 at 2015-06-14 11:00:09
你自己做个BLAST分析确定下你提交的序列1、3、4、5、6,然后根据结果改下。...

麻烦问一下,我提交了一个序列,邮件显示成功了,但是在我的提交那里找不到我提交的序列,请问你知道怎么回事么?
7楼2021-01-05 21:34:28
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T小白一枚T

新虫 (小有名气)

楼主解决了吗?我也遇到了这样的问题,不知道那里出错了
8楼2022-05-11 22:38:15
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