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jasonsl2010金虫 (小有名气)
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关于matlab使用 和瑞利散射的去除已有1人参与
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请问一下虫友们，谁会使用matlab去除三维荧光中的瑞利散射，请赐教，非常感谢。 我查阅了相关的文献，看到一篇是用delaunay三角形内插值去除的，但是没有看明白。如果过有谁会用的话也请私密我。非常感谢。 |
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xym_1900
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我不是太明白这段程序对数据输入格式的要求。那按照它的要求应该是什么样的？因为我目前数据输入运行的时候总会出错。出错在一段这样的程序“Q=isnan（X.data）”给出的解释是“NaN element at the original data due to emission out of spectroscopic instrumental range”似乎是说由于发射波长超出了光谱仪器的范围，NaN元素存在于原始数据。这个我理解不了，是我的发射波长范围有问题？我看了eemscat的程序也没看出什么结果来，我程序方面的认知有限 发自小木虫IOS客户端 |
19楼2016-11-09 13:52:16
20楼2019-02-06 22:02:21
【答案】应助回帖
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jasonsl2010: 金币+20, ★有帮助 2015-01-21 16:13:16
jasonsl2010: 金币+20, ★有帮助 2015-01-21 16:13:16
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不知道你会不会matlab，会的话程序里都有说明，仔细看下，不会的话就得改改了 function [EEM_correct,EEM_Cutted_rrr2]=eemscat2(X,MissRayleh,MissRaman,MissRayleh2); 函数名2应该去掉改成eemscat 说明里的用法Example: % NewEEM = eemscat( X, [20 20], [10 10], [10 10]); % Data Rayleigh RamanWidth 2.orderRayleigh 主要用这句改改你的东西就行 EEMSCAT for removing Rayleigh and Raman scattering from fluorescence % EEM data and interpolating the excised areas. % % INPUT: % X X-array of EEMs. X is size IxJxK, where I is number of % samples, J emissions and K excitations. X has to be a % dataset object where the axisscales contain wavelengths. % You can convert an array to a dataset doing % X = dataset(X); % X.axisscale{2} = EmAx; % The emission wavelengths (nm) % X.axisscale{3} = ExAx; % The excitation wavelengths (nm) % % OPTIONAL INPUT % RayeleighWitdth % RayeleighWitdth is a two-element vector defining how many nanometers % to the left and right of the Rayleigh center is removed. Use % [0 0] to avoid removing. Default if not given is [25 25]; % % % RamanWidth % As above but for Raman. Default is [0 0]. Assumes water samples % (for the position of the Raman scatter) % % Rayleigh2Width % As above but for second order Rayleigh scatter. Default is none % [0 0]. % % %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%% % Example: % NewEEM = eemscat( X, [20 20], [10 10], [10 10]); % Data Rayleigh RamanWidth 2.orderRayl % % %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%% % OUTPUT: % % NewEEM EEM data with interpolated areas. % % Additional optional output % EEMNaN EEM data with missing data rather than interpolated values % |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
xym_19006楼2015-01-21 15:28:34
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7楼2015-01-21 16:13:43
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11楼2015-01-22 10:55:30
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别人写的就是这个格式，你按他的调用就行。 % INPUT: % X X-array of EEMs. X is size IxJxK, where I is number of % samples, J emissions and K excitations. X has to be a % dataset object where the axisscales contain wavelengths. % You can convert an array to a dataset doing % X = dataset(X); % X.axisscale{2} = EmAx; % The emission wavelengths (nm) % X.axisscale{3} = ExAx; % The excitation wavelengths (nm) % |
18楼2016-11-09 11:28:08
【答案】应助回帖
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jasonsl2010: 金币+5 2015-01-21 14:29:13
感谢参与，应助指数 +1
jasonsl2010: 金币+5 2015-01-21 14:29:13
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这里有程序啊，直接可以用吧 http://www.models.life.ku.dk/EEM_correction |
2楼2015-01-21 14:15:55
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