【调剂】北京石油化工学院2024年16个专业接受调剂
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liangjun44

至尊木虫 (著名写手)

[求助] ms中设置分子的颜色

请问在ms中怎样设置分子的颜色?有三种分子,为了区分,我在画分子的时候标记了颜色,但用ac构建后分子的颜色变回灰色,请问怎么设置呢?
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uuv2010

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【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
AC重构是什么意思?
如果是简单地区分不同原子的颜色的话,最简单的办法是将这几个原子设置成不同的元素类型
2楼2012-05-31 15:03:38
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liangjun44

至尊木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by uuv2010 at 2012-05-31 15:03:38
AC重构是什么意思?
如果是简单地区分不同原子的颜色的话,最简单的办法是将这几个原子设置成不同的元素类型

我的意思是Amorphous Cell模块中构建元胞,不是重构
设置成不同的元素?怎么操作的?设置成不同的元素会不会使结果不一样的?
3楼2012-05-31 15:30:33
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uuv2010

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【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by liangjun44 at 2012-05-31 15:30:33
我的意思是Amorphous Cell模块中构建元胞,不是重构
设置成不同的元素?怎么操作的?设置成不同的元素会不会使结果不一样的?...

如果是简单地区分不同原子的颜色的话,最简单的办法是将这几个原子设置成不同的元素类型
如果是计算的需要的话,是不可以的
我说的方法仅仅是对显示而言的
4楼2012-05-31 18:52:32
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liangjun44

至尊木虫 (著名写手)

现在让我自己来回答一下吧。
开始的时候为了容易区分体系里面的不同分子,想以颜色作为区分,于是在画分子的时候便设置了不同的颜色,想着在Amorphous Cell模块构建原胞后能够区分开来。但结果是不行的,Amorphous Cell构建的原胞里面,分子的颜色并不是所画的分子的颜色而是默认的颜色。

假如像自己当初一样想要区分分子的话,可以在Amorphous Cell模块构建好原胞后对分子的颜色进行设置,用到的是Find patterns。
先在一个xsd文件中保存单个分子,然后保证其处于打开的状态,然后也保证动力学运行的轨迹文件xtd文件处于打开(active)的状态。选择edit菜单里面的find patterns,里面pattern document选择你保存的xsd文件,然后下面match property选择ElementType,转向轨迹文件,点击find就可以了。这样便可选中全部目标分子,然后在轨迹文件里面按右键设置分子的颜色就好了。
5楼2012-06-22 21:57:18
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wuguohao111

银虫 (正式写手)

可以去QQ群246710001讨论
6楼2012-06-25 12:23:49
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hohoqing

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by liangjun44 at 2012-06-22 21:57:18
现在让我自己来回答一下吧。
开始的时候为了容易区分体系里面的不同分子,想以颜色作为区分,于是在画分子的时候便设置了不同的颜色,想着在Amorphous Cell模块构建原胞后能够区分开来。但结果是不行的,Amorphous ...

你好,请问找出全部目标分子之后如何全部选中呢
7楼2021-04-21 16:56:20
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