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沙风

铁杆木虫 (正式写手)


[资源] 自己制作的用vasp产生charge density difference的步骤,以及用vesta处理得到最终的图

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fengangelo

禁虫 (小有名气)

本帖内容被屏蔽

11楼2012-03-23 20:04:01
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courage201

金虫 (正式写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

写的很详细,支持原创!顶一下,感谢分享!
12楼2012-03-23 21:24:57
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kgdu

金虫 (正式写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

感谢分享!!!!!!!!!
14楼2012-03-23 23:26:47
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fzuvivi

金虫 (小有名气)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

支持原创工作!非常感谢分享~
22楼2012-03-25 10:13:36
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江山2010

木虫 (小有名气)


我看了一下这个文件,在第13页中NOTE: The unit of charge density in CHGCAR is e/Bohr3. 用vasp导出的CHGCAR的格式是以埃作为单位的,为什么说是用玻尔半径作为单位的呢?我们在读取等值面的时候怎样写单位呢?
48楼2012-03-31 09:15:30
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沙风

铁杆木虫 (正式写手)


引用回帖:
48楼: Originally posted by 江山2010 at 2012-03-31 09:15:30:
我看了一下这个文件,在第13页中NOTE: The unit of charge density in CHGCAR is e/Bohr3. 用vasp导出的CHGCAR的格式是以埃作为单位的,为什么说是用玻尔半径作为单位的呢?我们在读取等值面的时候怎样写单位呢?

我是在他们vasp的官方论坛上看到有人提到导出的单位是e/Bohr3,不是e/A3.你说“用vasp导出的CHGCAR的格式是以埃作为单位的”这句的依据从哪里来的?
50楼2012-03-31 22:17:16
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fzuvivi

金虫 (小有名气)


您所做的应该是二次差分密度吧?这与差分密度是否不同?我对差分密度的理解是:AB原子成键后的自洽电荷密度-AB原子成键前的非自洽电荷密度(即A,B原子机械的放置在胞中)。楼主能否指点一二,谢谢!

另外,在您的INCAR中,为什么要让电子进行自洽循环(设NELMIN的目的为何)?这个没想明白。。。

多谢
51楼2012-04-01 09:03:14
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veryman

木虫 (正式写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

引用回帖:
50楼: Originally posted by 沙风 at 2012-03-31 22:17:16:
我是在他们vasp的官方论坛上看到有人提到导出的单位是e/Bohr3,不是e/A3.你说“用vasp导出的CHGCAR的格式是以埃作为单位的”这句的依据从哪里来的?

VASP输出的CHGCAR好像真的是e/A3,然后用VESTA打开的时候会把单位换算成e/Bohr3.
但是我不是很确定,不知道有没有大大研究一下,然后给个指条明路?
54楼2012-04-01 17:56:09
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沙风

铁杆木虫 (正式写手)


引用回帖:
51楼: Originally posted by fzuvivi at 2012-04-01 09:03:14:
您所做的应该是二次差分密度吧?这与差分密度是否不同?我对差分密度的理解是:AB原子成键后的自洽电荷密度-AB原子成键前的非自洽电荷密度(即A,B原子机械的放置在胞中)。楼主能否指点一二,谢谢!

另外,在 ...

我对二次差分密度和差分密度的概念不是太清楚,我做的这个charge density difference是这样的:系统AB原子成键后的自洽电荷密度-A、B两部分的原子成键前的自洽电荷密度。我认为让电子进行自洽循环的目的是为了让A、B两部分的原子中的电子达到平衡,这样计算出来的电荷密度差才是这两部分在一起成键后引起的电子分布的变化。这是我的浅显理解,希望能有专家来给指导下。
55楼2012-04-01 18:04:31
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沙风

铁杆木虫 (正式写手)


引用回帖:
54楼: Originally posted by veryman at 2012-04-01 17:56:09:
VASP输出的CHGCAR好像真的是e/A3,然后用VESTA打开的时候会把单位换算成e/Bohr3.
但是我不是很确定,不知道有没有大大研究一下,然后给个指条明路?

我在文献上看到标注这两种单位的都有,不知道他们转化没有。一直没有找到权威的依据。不过这个单位对于分析电子分布的变化和转移没有影响,这个也可能是大家不太在意这个单位的原因吧。希望能有专家给指导一下这个。
56楼2012-04-01 18:08:08
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Tea_Candy

金虫 (小有名气)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

太感谢了,正需要这方面的资料
61楼2012-04-06 19:46:27
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建军

银虫 (正式写手)


我是个新手  想请教楼主一下   VASP和MS有什么区别呢?然后  优缺点什么的?麻烦楼主讲解一下
65楼2012-04-07 18:01:22
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铁昂笑

铜虫 (小有名气)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

非常实用,感谢分享,加油!
66楼2012-04-08 13:28:27
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沙风

铁杆木虫 (正式写手)


引用回帖:
65楼: Originally posted by 建军 at 2012-04-07 18:01:22:
我是个新手  想请教楼主一下   VASP和MS有什么区别呢?然后  优缺点什么的?麻烦楼主讲解一下

这个问题比较大 我也没资格能说出啥优缺点,从我自身用的体会上可以发表点自己的看法。严格的说不能拿VASP和MS比,MS是一个商业化很高的集成平台,里面包括很多模块,VASP只能和MS中的DMol和CASTEP模块比较,从基础上说,都是DFT模块。简单的说,如果你老板钱多就用MS,穷人用不起啊。MS的界面那是没的说,是相当的强大,建结构,分析结果等等。。。
我刚开始用vasp不久,不敢妄加评论,虽然vasp没有界面,需要其他的一些软件来辅助做结构什么的,它能计算的性能还是蛮多的。
67楼2012-04-08 18:34:52
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轻轻飘过之

金虫 (正式写手)


想向楼主请教一下,在做二维的电荷密度图时,在contours选框中有一个选项,可以选择线性画图和对数形式画图,这两种画图方式有什么差别吗?我看着对数形式画出的图较接近文献上看到的图,而线性形式画出的图太乱了。还有,在用对数形式画图时,电子数目小于1的就会画出负的等高线,这样就与得到了电子的实际情况不一致了,这又怎么解释啊?
69楼2012-04-10 16:40:28
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沙风

铁杆木虫 (正式写手)


引用回帖:
69楼: Originally posted by 轻轻飘过之 at 2012-04-10 16:40:28:
想向楼主请教一下,在做二维的电荷密度图时,在contours选框中有一个选项,可以选择线性画图和对数形式画图,这两种画图方式有什么差别吗?我看着对数形式画出的图较接近文献上看到的图,而线性形式画出的图太乱了 ...

不好意思啊,这个我也不太清楚
71楼2012-04-11 20:19:56
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tangtiecheng

新虫 (初入文坛)


★★★ 三星级,支持鼓励

很有用的东西,支持楼主
108楼2012-05-04 09:54:35
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hmin66

新虫 (小有名气)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

正想找这方面的资料呢,楼主真是雪中送炭啊,好好研究下……
124楼2012-05-22 08:31:47
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nichelle

新虫 (初入文坛)


就是我想要的,很感谢
165楼2012-09-04 16:00:31
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

mfshun1013

铁杆木虫 (著名写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

感谢分享!预祝楼主发牛文章!!
216楼2012-12-09 11:03:25
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huangll99

木虫 (职业作家)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

顶一下,感谢分享!

楼主不会是韩国人吧
3楼2012-03-23 10:49:09
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沙风

铁杆木虫 (正式写手)


沙风: 取消置顶 2012-03-23 12:34:27
引用回帖:
3楼: Originally posted by huangll99 at 2012-03-23 10:49:09:
顶一下,感谢分享!

楼主不会是韩国人吧

当然不是,我是中国人。
4楼2012-03-23 12:34:14
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hakuna

木虫 (知名作家)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

挺好!
顶一下,感谢分享!
20楼2012-03-24 13:44:51
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chenyuchen

木虫 (正式写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

很好,多谢分享!
21楼2012-03-24 17:55:32
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wanglianli136

铁杆木虫 (著名写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

支持师兄!
27楼2012-03-25 20:12:32
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★★★★★ 五星级,优秀推荐

LZ是延世大的?
29楼2012-03-25 21:04:16
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沙风

铁杆木虫 (正式写手)


引用回帖:
29楼: Originally posted by souledge at 2012-03-25 21:04:16:
LZ是延世大的?

是的,目前在延世
30楼2012-03-25 21:38:18
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dwma

铁杆木虫 (正式写手)


代码呢!
37楼2012-03-26 09:51:59
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mumuyh

金虫 (小有名气)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

非常感谢分享
43楼2012-03-29 20:52:06
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sleep桉

新虫 (初入文坛)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

顶一下,感谢分享!支持原创
45楼2012-03-29 21:46:06
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简单回复
gy8505012楼
2012-03-23 10:46   回复  
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2012-03-23 14:23   回复  
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2012-03-23 14:48   回复  
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xueht9877楼
2012-03-23 14:55   回复  
五星好评  
2012-03-23 15:43   回复  
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tangsw9119楼
2012-03-23 16:08   回复  
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wuxb10楼
2012-03-23 16:51   回复  
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bird00713楼
2012-03-23 22:56   回复  
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2012-03-24 07:24   回复  
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cmmtt17楼
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youzhizhe19楼
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luxia021023楼
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zzggbb24楼
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swear_wei26楼
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xueht98728楼
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snail59444楼
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seaso47楼
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