【调剂】北京石油化工学院2024年16个专业接受调剂
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jianqin

金虫 (正式写手)

[求助] GAMESS中几何优化和频率计算同时做应如何输入

如题,想在GAMESS中进行几何优化后马上做频率计算,看是否有虚频,就像gaussian中一样。请问输入文件应该怎么写?用MacMolPlt可以方便地构建几何优化的input file,那么频率计算如何输入?是否是runtyp=optimize后面加上runtyp=hessian,METHOD=ANALYTIC VIBANL=.TRUE.这些?
用gaussian做freq可以得到化合物的零点能,焓,吉布斯自由能等数据,gamess中的freq是否可以?
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yflchx

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

jianqin(金币+10): THX 2011-08-31 19:47:16
引用回帖:
1楼: Originally posted by jianqin at 2011-08-30 17:29:18:
如题,想在GAMESS中进行几何优化后马上做频率计算,看是否有虚频,就像gaussian中一样。请问输入文件应该怎么写?用MacMolPlt可以方便地构建几何优化的input file,那么频率计算如何输入?是否是runtyp=optimize后 ...

$CONTRL SCFTYP=RHF RUNTYP=OPTIMIZE DFTTYP=wB97X-D MAXIT=200 ICHARG=-1 MULT=1 MOLPLT=.TRUE. $END
$SYSTEM TIMLIM=525600 MEMORY=10000000 $END
$BASIS GBASIS=N31 NGAUSS=6 NDFUNC=1 NPFUNC=1 DIFFSP=.TRUE. $END
$SCF NCONV=9 $END
$STATPT OPTTOL=0.0001 NSTEP=100 HSSEND=.t. $END
$DATA

分子结构省略。
2楼2011-08-30 22:27:38
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jianqin

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by yflchx at 2011-08-30 22:27:38:
$CONTRL SCFTYP=RHF RUNTYP=OPTIMIZE DFTTYP=wB97X-D MAXIT=200 ICHARG=-1 MULT=1 MOLPLT=.TRUE. $END
$SYSTEM TIMLIM=525600 MEMORY=10000000 $END
$BASIS GBASIS=N31 NGAUSS=6 NDFUNC=1 NPFUNC=1 D ...

谢谢!还想请问nconv这个值设多少合适?gamess默认是5或6(根据他的手册),但是在gaussian中类似的参数值是8. 按gamess默认值得到的结果是不是准确度不够?
3楼2011-08-31 19:42:38
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yflchx

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by jianqin at 2011-08-31 19:42:38:
谢谢!还想请问nconv这个值设多少合适?gamess默认是5或6(根据他的手册),但是在gaussian中类似的参数值是8. 按gamess默认值得到的结果是不是准确度不够?

可以根据GAUSSIAN设成8。

我曾经用MP2和DFT比较过SCF与优化的收敛标准,

一般情况下我觉得设成6就可以了。

当然,不同的体系可能会不一样,最好根据自己的实际情况进行比较。

需要注意的是DRC计算对SCF的收敛精度要求很高,至少要到9,因为只有这样才

能得到精确的梯度。
4楼2011-08-31 21:54:53
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jianqin

金虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by yflchx at 2011-08-31 21:54:53:
可以根据GAUSSIAN设成8。

我曾经用MP2和DFT比较过SCF与优化的收敛标准,

一般情况下我觉得设成6就可以了。

当然,不同的体系可能会不一样,最好根据自己的实际情况进行比较。

需要注意的是DRC计算对 ...

还有gaussian做opt后用freq可以得到化合物的零点能,焓,吉布斯自由能等数据,在gamess中用什么关键词可以算这些数据?
5楼2011-08-31 22:18:57
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yflchx

金虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by jianqin at 2011-08-31 22:18:57:
还有gaussian做opt后用freq可以得到化合物的零点能,焓,吉布斯自由能等数据,在gamess中用什么关键词可以算这些数据?

$STATPT OPTTOL=0.0001 NSTEP=100 HESS=CALC HSSEND=.t. $END
$FORCE METHOD=SEMINUM VIBSIZ=0.010000 VIBANL=.TRUE. $END


使用HSSEND=.t.之后,在输出文件的末尾就会有下面的输出结果。

挑选你想要的就可以了。



  -------------------------------
     THERMOCHEMISTRY AT T=  298.15 K
     -------------------------------

USING IDEAL GAS, RIGID ROTOR, HARMONIC NORMAL MODE APPROXIMATIONS.
P=  1.01325E+05 PASCAL.
ALL FREQUENCIES ARE SCALED BY   1.00000
THE MOMENTS OF INERTIA ARE (IN AMU*BOHR**2)
      8.48840   466.28629   466.98211
THE ROTATIONAL SYMMETRY NUMBER IS  2.0
THE ROTATIONAL CONSTANTS ARE (IN GHZ)
    212.41782     3.86691     3.86115
   1 IMAGINARY FREQUENCY VIBRATION(S) IS(ARE) EXCLUDED
     FROM THE FOLLOWING THERMOCHEMICAL ANALYSIS.
THE HARMONIC ZERO POINT ENERGY IS (SCALED BY   1.000)
        0.028683 HARTREE/MOLECULE     6295.280937 CM**-1/MOLECULE
       17.999129 KCAL/MOL               75.308358 KJ/MOL

               Q               LN Q
ELEC.     1.00000E+00       0.000000
TRANS.    1.56038E+07      16.563028
ROT.      7.69486E+03       8.948308
VIB.      1.95841E+00       0.672134
TOT.      2.35145E+11      26.183470

              E         H         G         CV        CP        S           KJ/MOL    KJ/MOL    KJ/MOL   J/MOL-K   J/MOL-K   J/MOL-K
ELEC.      0.000     0.000     0.000     0.000     0.000     0.000
TRANS.     3.718     6.197   -41.059    12.472    20.786   158.498
ROT.       3.718     3.718   -22.182    12.472    12.472    86.872
VIB.      78.383    78.383    73.642    22.331    22.331    15.902
TOTAL     85.820    88.299    10.401    47.275    55.589   261.271
VIB. THERMAL CORRECTION E(T)-E(0) = H(T)-H(0) =  3074.972 J/MOL

              E         H         G         CV        CP        S         KCAL/MOL  KCAL/MOL  KCAL/MOL CAL/MOL-K CAL/MOL-K CAL/MOL-K
ELEC.      0.000     0.000     0.000     0.000     0.000     0.000
TRANS.     0.889     1.481    -9.813     2.981     4.968    37.882
ROT.       0.889     0.889    -5.302     2.981     2.981    20.763
VIB.      18.734    18.734    17.601     5.337     5.337     3.801
TOTAL     20.512    21.104     2.486    11.299    13.286    62.445
VIB. THERMAL CORRECTION E(T)-E(0) = H(T)-H(0) =   734.936 CAL/MOL
......END OF NORMAL COORDINATE ANALYSIS......
6楼2011-08-31 22:24:43
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201110140244

新虫 (初入文坛)

请问各位为什么的在做结构优化时, 总是得到GRADIENT OUT OF RANGE, 请问这是什么原因呢,希望得到大家的解答。 我是个新手,这个问题困扰我很久了, 联系方式qq:1056757198 微信: yfecha
7楼2019-03-18 23:27:38
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201110140244

新虫 (初入文坛)

input 文件如下:
  $CONTRL SCFTYP=UHF RUNTYP=OPTMIZE EXETYP=routine MAXIT=200 $END
  $SYSTEM TIMLIM=525600 MEMORY=100000000 $END
  $ BASIS GBASIS=N21 NGAUSS=3 $END
  $SCF DIRSCF=.TRUR. CONV=1.0d-06 RESET=.TRUE. $END
  $STATPT METHOD=SCHLEGEL OPTTOL=0.000005 NSTEP=100 IFOLOW=-1 RMAX=0.8 $END
  $ DATA
1st row is reserved for a comment
C1
O  8.0  0.086  0.095  0.00
H  1.0  0.740  1.242  0.00
H  1.0   -1.07  0.430  0.00
$END
8楼2019-03-18 23:36:19
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