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gavinliu7390

木虫 (著名写手)

叶落鹰飞

[交流] 【其他】在线答疑:VASP的问题已有101人参与

vasp是一个很不错的软件,尤其称道的是他的计算速度和稳定性。
由于wuchenwf版主即将隐退,特开此贴。
本人能力也极其有限,所以在此抛砖引玉,标题虽是答疑,但是我觉得更应该是讨论。大家术业有专攻,VASP的每个方面不可能都掌握。希望和大家也共同进步。

老帖地址(供大家参考)(wuchenwf):http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1740019&fpage=1

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老帖地址(供大家参考)(wuchenwf):http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1083523
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gavinliu7390

木虫 (著名写手)

叶落鹰飞

引用回帖:
294楼: Originally posted by 佳佳988 at 2014-08-17 00:57:16
一个气体分子在晶胞边界线上,该分子的部分原子已超出单个晶胞,请问能否用VASP计算呢?一般都是在晶胞之内,CONTCAR的数据也都小于1。

可以用,因为vasp用的是周期性晶体。超出部分也可以看成是晶胞内。
真理是一点点接近的!
295楼2014-08-17 07:24:47
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cuicui2397

新虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
送红花一朵
前辈你好,由于要学习第一性原理,之前一直在学习ms这个软件,现在要安装vasp软件,由于对linux不熟悉,身边又没有能帮上忙的,所以对于vasp安装很是头疼,查了很多安装教程,由于系统版本不同以及所选用的库,软件不同,搞了快两周了,也没搞定,求帮助啊!我用的是ubuntu11.10系统,l_fcompxe_2013.1.117.tgz,mpich2,vasp5.2,由于电脑上还安装有lammps软件,所以已经安装了mpich2和fftw。求帮助啊!谢谢!
251楼2013-09-20 11:25:37
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gavinliu7390

木虫 (著名写手)

叶落鹰飞

引用回帖:
262楼: Originally posted by 葵cc_ at 2014-03-20 14:44:12
你好,我刚接触VASP,很多东西一头雾水,看了很多资料,我的理解是做任何材料的计算之前都应该先测试一些参数,比如ENCUT、KPOINTS、ISMEAR、SIGMA,结构优化得晶格常数。请问这些测试有没有先后顺序呢?我应该先固 ...

我的意思是,顺序一般影响不大。
真理是一点点接近的!
264楼2014-03-21 03:43:43
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gavinliu7390

木虫 (著名写手)

叶落鹰飞

引用回帖:
281楼: Originally posted by 伤心春草 at 2014-04-08 11:48:22
楼主:我上个问题解决了,只是K点0.375写成了0.325.。。囧

我现在在算ZnO纤锌矿结构,经查询其原来的空间群为P63mc,但在用phonopy做声子谱时它说空间群为Spacegroup:  Ccm2_1 (36)

不知道为什么哎。。

PO ...

你在执行phonopy的时候,加入参数--tolerance=0.01 就可以了。 phonopy --tolerance=0.01
真理是一点点接近的!
282楼2014-04-08 12:32:22
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普通回帖

lishufei

金虫 (正式写手)

vasp安装


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
问一下前辈
今天我把vasp4.6安装成功啦。
但我在输入命令vasp时不能运算。
说是找不到这个命令。
怎样改一下啊。
我su后口令
vasp它还说找不到命令。
怎么办啊   我明明安装是成功的啊



好像以前师兄把root 改成bin
怎么改? 谢谢前辈啊
2楼2010-04-13 21:12:08
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lishufei

金虫 (正式写手)

★ ★
xiaohunhun(金币+2):xiexie 2010-04-13 22:53
gavinliu7390:你的编译过程应该没问题。 2010-04-14 07:41
说明一下我安装的是串行的安装方法如下:
vasp4.6 安装全部过程
串行所需文件
l_fc_c_9.1.036.tar     l_mkl_p_9.1.023.tar    makefile 串行    NCOM_L_MKL__NP5T-TXVGVMK8.lic     vasp.4.6.tar.gz       vasp.4.lib.tar.gz
NCOM_L_CMP_FOR_NC5M-MNS7LCG3.lic
1. 解压l_mkl_p_9.1.023.tar
    命令 tar  -xvf  l_mkl_p_9.1.023.tar
     进入l_mkl_p_9.1.023   命令cd l_mkl_p_9.1.023
     安装 ./install.sh
     以后按照安装说明进行。
2  解压 l_fc_c_9.1.036.tar
    命令  tar  -xvf l_fc_c_9.1.036.tar
     进入l_fc_c_9.1.036 命令 cd  l_fc_c_9.1.036.tar
     安装 ./install.sh
     以后按照安装说明进行。
注意所有安装都在root下 进入安装说明里会有提示。
3   改变量环境
    退出后 进入根目录su 口令
     新目录要cd 再回车 显示~
     输入 vi .bashrc  回车
     进入后改成   
      # .bashrc

      # User specific aliases and functions

        alias rm='rm -i'
        alias cp='cp -i'
        alias mv='mv -i'
        PATH="$PATH:/usr/local/bin"  (该部分为mpich2的路径)注意安装并行才用
        # Source global definitions
         if [ -f /etc/bashrc ]; then
        . /etc/bashrc

       fi   (以下为mkl及fortran安装后需设置的环境变量)
         export  LD_LIBRARY_PATH=/opt/intel/mkl/9.1.023/lib/em64t:/opt/intel/fce/9.1.036/lib
. /opt/intel/fce/9.1.036/bin/ifortvars.sh
export  LD_LIBRARY_PATH=/opt/intel/fce/9.1.036/bin/ifortvars.sh:$LD_LIBRARY_PATH
注意进入后按i才能对内容修改。
改好后按esc键 :wq 这是保存并退出。
保存后在终端执行命令source /root/.bashrc就可以了
执行没错即可。
4  进入放文件的目录 cd  
  解压vasp.4.6.tar.gz    和   vasp.4.lib.tar.gz
   tar xzvf vasp.4.6.tar.gz  和tar xzvf vasp.4.lib.tar.gz
进入vasp.4.lib目录 cd vasp.4.lib
cp makefile.linux_ifc_P4  makefile
打开makefile文件修改FC=ifort 保存文件
make
编译成功后,得到libdmy.a文件。
5  退出vasp.4.lib目录 进入vasp.4.6目录
  把上面的makefile拷贝到vasp.4.6里去。(这里面是修改过的不需要改动)
进行make
运行结束安装成功。如果显示某行错误可在打开makefile文件找到那行,如果前面没有#就加上#,如果有#就去掉#。在进行make。
3楼2010-04-13 21:14:24
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gavinliu7390

木虫 (著名写手)

叶落鹰飞

★ ★ ★ ★ ★
aylayl08(金币+5):谢谢解答 2010-04-15 08:38
引用回帖:
Originally posted by lishufei at 2010-04-13 21:12:08:
问一下前辈
今天我把vasp4.6安装成功啦。
但我在输入命令vasp时不能运算。
说是找不到这个命令。
怎样改一下啊。
我su后口令
vasp它还说找不到命令。
怎么办啊   我明明安装是成功的啊



好像以前师兄 ...

如果你的vasp已经编译成功,找不到命令。一般解决办法有三种。由于编译好后会生成一个vasp文件。
一,你可以将这个vasp文件考到~/bin目录下。然后在系统的任何位置都可以执行vasp.
二,如果上面的方法不可以,你就考到/usr/local/bin 目录下,不过这个需要超级用户密码。
三,例如你编译成功的目录是~/software/vasp/,你在任何位置执行的时候可以直接执行~/software/vasp/vasp, 也可以。
真理是一点点接近的!
4楼2010-04-14 07:39:56
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lishufei

金虫 (正式写手)

谢谢楼主
5楼2010-04-14 09:43:52
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lishufei

金虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
请问楼主
具体操作时什么?
怎么找到我的vasp文件?在什么目录下拷贝?怎样拷贝到/bin下啊?
问题可能太弱啦
因为我好长时间没用过linux系统啦
6楼2010-04-14 09:49:02
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gavinliu7390

木虫 (著名写手)

叶落鹰飞


aylayl08(金币+1):谢谢解答 2010-04-15 08:38
引用回帖:
Originally posted by lishufei at 2010-04-14 09:49:02:
请问楼主
具体操作时什么?
怎么找到我的vasp文件?在什么目录下拷贝?怎样拷贝到/bin下啊?
问题可能太弱啦
因为我好长时间没用过linux系统啦

你在哪个文件夹编译的,在那里会找到vasp
cp vasp ~/bin
真理是一点点接近的!
7楼2010-04-14 11:11:34
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babaleo

木虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
gavinliu7390(金币+1):谢谢交流! 2010-04-18 09:25
$which vasp
如果vasp的路径有显示, 应可执行.
8楼2010-04-18 03:22:29
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amygod

木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
vasp可以计算吸附热吗?
9楼2010-04-18 12:32:49
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gavinliu7390

木虫 (著名写手)

叶落鹰飞

引用回帖:
Originally posted by amygod at 2010-04-18 12:32:49:
vasp可以计算吸附热吗?

没搞过。
只要弄明白是怎么回事,就应该能做。
真理是一点点接近的!
10楼2010-04-19 21:52:39
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